吸附时吸附质的应该怎么放置？

qcbuwyx · 发表于 Post on 2025-3-6 20:22:48

单层本征WSe2进行NO2的吸附，进行W/Se顶位的吸附位点吸附时，应该按照分子中的各原子位置又分别多方向（水平放置，垂直放置）进行对各吸附位点的几何结构优化，还是可以选择分子的质心进行顶位的吸附且不需要在意水平和竖直的放置位置几何结构优化会调整到最优位置？

PLwang · 发表于 Post on 2025-3-7 13:21:21

本帖最后由 PLwang 于 2025-3-7 13:23 编辑

一般来说，结构优化不能保证优化到全局的能量最小值点，其只能优化到局部的最小值点。所以你最后的优化结果，是会收到你初始的结构的影响的。
至于怎么放，一个比较复杂的方法是，尝试多种放置方式。比如我分子可能由两个吸附位点，最好对每一个位点都进行测试；一个比较简单但不是很推荐的方法是，在MS使用forcite模块做非常快的预优化。

liuxp · 发表于 Post on 2025-3-7 14:59:46

PLwang 发表于 2025-3-7 13:21
一般来说，结构优化不能保证优化到全局的能量最小值点，其只能优化到局部的最小值点。所以你最后的优化结果 ...

请问一下用forcite模块，需要怎么设置呢

zblxyrz · 发表于 Post on 2025-3-8 11:20:45

用xtb跑个动力学

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[建模与可视化] 吸附时吸附质的应该怎么放置？

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