CP2K使用Dimer对CI-NEB寻找的过渡态进行矫正结构出现问题

jifeng131381 · 发表于 Post on 2025-3-9 17:52:29

本帖最后由 jifeng131381 于 2025-3-9 18:01 编辑

各位老师好，我计算了4CP在Pd上脱氯过渡态，先CI-NEB跑了一下，然后使用Dimer矫正CI-NEB过度态的结构，结果我跑了差不多四天Dimer后发现最新结构很离谱，不知是哪里的问题。

Hedonism · 发表于 Post on 2025-3-9 20:38:56

可以把Dimer跑出来每一步的轨迹文件放到VMD里看看，可能是哪一步开始发生键长突变了

sobereva · 发表于 Post on 2025-3-9 22:33:57

dimer运行过程中就要经常查看优化轨迹，跑飞了及时停止，哪能白浪费4天。
dimer能否受力收敛有时候严重取决于初始的dimer朝向，提供合理的初始朝向会令收敛更为顺利

北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/KFP）里专门说了这点：

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