计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 654|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 高斯计算铁的PBC问题请教

[复制链接 Copy URL]

12

帖子

0

威望

181

eV
积分
193

Level 3 能力者

根据大佬对于pbc计算博文http://bbs.keinsci.com/forum.php ... d=146&highlight=PBC学到了以下输入文件,文件正常结束,但是算出来的结果和同样泛函基组下单独Fe原子计算E值差了一百kcal/mol,差距太大感到疑惑,是我输入文件没有学好嘛?

2_5aFe20.com

268 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 7

4104

帖子

4

威望

8869

eV
积分
13053

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2025-3-12 20:33:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2025-3-12 21:02 编辑

(1)算不了,不要用小刀砍大树。周期性计算就要用适合 周期性计算的程序,例如CP2K/QE/VASP/ABACUS。注意,我没有让你说只能学习VASP,不要误解了。学习道路一旦偏了,只能在毕不了业延期的时候(侥幸可能)算出你想要的东西。
(2)孤立Fe原子 对应的是 一个很大的单胞中间放一个Fe原子,不是你这种铁单胞,您结构搞错了。
(3)关键词严重不合理。iop(5/13=1,5/33=1)都跑出来了。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

890

帖子

3

威望

1680

eV
积分
2630

Level 5 (御坂)

傻傻的木瓜

3#
发表于 Post on 2025-3-12 20:33:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-3-12 21:55 编辑

别乱用关键词,参考
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331http://bbs.keinsci.com/thread-3460-1-1.html
如果刚开始做计算,仔细阅读
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html

你链接的帖子12楼的更新的回复都指出了做正经的周期性体系计算该用什么、如何学习,我实在不理解为何不好好读完帖子……
√546=23.36664289109

143

帖子

0

威望

1055

eV
积分
1198

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2025-3-12 21:16:16 | 只看该作者 Only view this author
我看到了不得了的东西。“iop(5/13)=1”,这可不兴学啊。
愿艾欧尼亚之灵指引你。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120132

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2025-3-13 02:34:16 | 只看该作者 Only view this author
差值对应内聚能
北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)里专门讲了。如果你要长期做正经的第一性原理计算,十分建议通过此培训系统性学学。另外,Gaussian的PBC功能属于玩具级的,能表现出实用性的场合很少。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

12

帖子

0

威望

181

eV
积分
193

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-10 12:55:23 | 只看该作者 Only view this author
后续是用高斯对Fen(n=1-16)都进行了计算,最后取一个相对能量最低的,审稿人没有再说这个问题,不过一般高斯计算不会遇到这个问题。

890

帖子

3

威望

1680

eV
积分
2630

Level 5 (御坂)

傻傻的木瓜

7#
发表于 Post on 2025-5-10 14:24:49 | 只看该作者 Only view this author
ovovovo 发表于 2025-5-10 12:55
后续是用高斯对Fen(n=1-16)都进行了计算,最后取一个相对能量最低的,审稿人没有再说这个问题,不过一般高 ...

这意思是把铁晶胞换成一堆小型孤立铁原子团簇,再除以原子数来计算所谓“单原子铁”的能量?听起来还是不靠谱,孤立过渡金属团簇这种强相关体系的能量计算绝对没这么简单。自旋多重度不唯一,每个自旋多重度下稳定波函数解也可能不唯一,都不知道怎么考虑的。而且小团簇的表面效应太明显了,和晶体的体相环境差异巨大。

审稿人不质疑不代表结果真的合理,说难听点,这次被放过去不能保证以后还可以蒙混过关,用错误的方法发文章等于同时给自己和后人挖坑。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
zjxitcc + 2 正解

查看全部评分 View all ratings

√546=23.36664289109

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 01:11 , Processed in 0.224881 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list