在超算平台进行CI-NEB计算中关于任务并行能否优化

ljh123 · 发表于 Post on 2025-3-15 20:12:15

CP2K中进行CI-NEB计算过渡态时，按照输入文件的设定，一共10个replica，每个replica分配3个核，向平台一共申请30个核。但是我发现每轮计算时，有几个replica先算完的话，也会等到其他replica算完才继续。这样好像导致每轮有好几个核心会空置一段时间。请问有没有方法可以用满核呢

reid · 发表于 Post on 2025-3-15 20:58:21

30个核跑10个，确实会很慢，除非是很小的体系。我这里都是用96核跑，经常需要1天左右

ljh123 · 发表于 Post on 2025-3-15 21:06:31

reid 发表于 2025-3-15 20:58
30个核跑10个，确实会很慢，除非是很小的体系。我这里都是用96核跑，经常需要1天左右

主要是发现，比如10个中，有4个先跑完了，6个还在跑。这时候相当于有12个核没在运行，但是超算平台上还是按照30个核在计费

reid · 发表于 Post on 2025-3-15 21:20:56

ljh123 发表于 2025-3-15 21:06
主要是发现，比如10个中，有4个先跑完了，6个还在跑。这时候相当于有12个核没在运行，但是超算平台上还是 ...

确实会这样，但好像没法设置

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