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[ORCA] 求助ORCA做CP校正报错

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各位老师,我在使用ORCA做CP校正时,参考了sob老师做CP校正的例子,在CCSD(T)/cc-PVQZ计算体系下进行了计算,我的输入文件如下:
%pal nprocs   40 end
! CCSD(T) cc-pVQZ tightSCF noautostart miniprint
%maxcore     8000
* xyz   0   6
Ti     0.52110186    0.11889480    0.09456427
Ti     1.59841912    2.28375665   -0.83047139
Ti    -0.84051084    2.31446306    0.51074888
Ti    -0.59732847    1.34517173   -1.96581057
Ti    -2.09809666    0.03480885   -0.01813699
Ti     1.75772708   -0.01907120   -2.19228759
Ti     1.46939454    1.66327692    1.90078577
Ti     3.12436797    0.08982412    0.07275700
Ti     1.57853288   -1.13341671    2.09721151
Ti     1.74522964   -2.12763111   -0.38498059
Ti    -0.61704707   -2.09997290    0.98133588
Ti    -0.85323750    0.20180149    2.31819566
Ti    -0.52312971   -1.47025422   -1.76208672
Na     1.80806481   -3.01869348   -3.55336724
*
$new_job
! CCSD(T) cc-pVQZ tightSCF noautostart miniprint Pmodel
%maxcore     8000
* xyz   0   7
Ti     0.52110186    0.11889480    0.09456427
Ti     1.59841912    2.28375665   -0.83047139
Ti    -0.84051084    2.31446306    0.51074888
Ti    -0.59732847    1.34517173   -1.96581057
Ti    -2.09809666    0.03480885   -0.01813699
Ti     1.75772708   -0.01907120   -2.19228759
Ti     1.46939454    1.66327692    1.90078577
Ti     3.12436797    0.08982412    0.07275700
Ti     1.57853288   -1.13341671    2.09721151
Ti     1.74522964   -2.12763111   -0.38498059
Ti    -0.61704707   -2.09997290    0.98133588
Ti    -0.85323750    0.20180149    2.31819566
Ti    -0.52312971   -1.47025422   -1.76208672
Na:     1.80806481   -3.01869348   -3.55336724
*
$new_job
! CCSD(T) cc-pVQZ tightSCF noautostart miniprint Pmodel
%maxcore     8000
* xyz   0   2
Ti:     0.52110186    0.11889480    0.09456427
Ti:     1.59841912    2.28375665   -0.83047139
Ti:    -0.84051084    2.31446306    0.51074888
Ti:    -0.59732847    1.34517173   -1.96581057
Ti:    -2.09809666    0.03480885   -0.01813699
Ti:     1.75772708   -0.01907120   -2.19228759
Ti:     1.46939454    1.66327692    1.90078577
Ti:     3.12436797    0.08982412    0.07275700
Ti:     1.57853288   -1.13341671    2.09721151
Ti:     1.74522964   -2.12763111   -0.38498059
Ti:    -0.61704707   -2.09997290    0.98133588
Ti:    -0.85323750    0.20180149    2.31819566
Ti:    -0.52312971   -1.47025422   -1.76208672
Na     1.80806481   -3.01869348   -3.55336724
*

由于是第一次使用CCSD(T)方法,所以不太清楚计算时长,就硬着头皮进行了计算,在计算了11天后应该是完成了第一部分的计算然后就报错了,报错的原因好像是内存不足,如下:
AUTOMATIC CHOICE OF INCORE LEVEL
--------------------------------
Memory available                           ...   4000.00 MB
Memory needed for S+T                      ... 132812.76 MB
Memory needed for J+K                      ... 265695.79 MB
Memory needed for DIIS                     ... 1859378.63 MB
Memory needed for 3-ext                    ... 1297240.91 MB
Memory needed for 4-ext                    ... 9622475.19 MB
Memory needed for triples                  ...  76308.29 MB
-> Final InCoreLevel    ... 0
Error (ORCA_MDCI): not enough memory for computing triples
  => Memory needed    :  76308.29 MB
  => Memory available :   4000.00 MB
[file orca_mdci/mdci_util.cpp, line 2321, Process 0]:       ... aborting the job
job aborted:
[ranks] message
[0-39] process exited without calling finalize
---- error analysis -----
[0-39] on DESKTOP-ICBVOIG
D:\ORCA\orca_mdci_mpi.exe ended prematurely and may have crashed. exit code 12
---- error analysis -----
ORCA finished by error termination in MDCI
Calling Command: mpiexec -np 40  D:\ORCA\orca_mdci_mpi.exe Ti13-Na-06.mdciinp.tmp Ti13-Na-06
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 394]:
  .... aborting the run
我的机子是40核128G的,在计算之前确实没有考虑到每个核的内存,就随手给了一个8000MB,但是在进行第一部分计算的时候每个核也只用了400MB的内存,所以不太明白为什么第二部分要这么大的内存。
综上,我的问题是:1.是因为并行核数太多内存太小而报错吗?
                             2.对于已经计算的第一部分的能量可以使用吗,后续再单独计算第二部分和第三部分结合CP校正的能量可以吗?
非常感谢各位老师。

Ti13-Na-06.inp

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Ti13-Na-06.out

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-23 20:09:56 | 只看该作者 Only view this author
我还有一个问题是:对于已经计算完的第一部分,是不是就是考虑了校正的复合物的能量,然后我就只用去计算第二部分和第三部分的单点能就行了呢

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发表于 Post on 2025-3-23 21:35:14 | 只看该作者 Only view this author
与其做CCSD(T)/cc-pVQZ,不如做CCSD(T)-F12/cc-pVTZ-F12,后者利用了F12方法校正基组误差,可以达到接近cc-pV6Z的精度,且不需要做counterpoise
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-23 22:02:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-3-23 21:35
与其做CCSD(T)/cc-pVQZ,不如做CCSD(T)-F12/cc-pVTZ-F12,后者利用了F12方法校正基组误差,可以达到接近cc- ...

非常感谢您,后续我会按您的建议做这个计算,只是现在这个计算级别是老师让我做的,所以我得先做一次计算。还有就是想请教您,我的第一部分计算能量能否使用呢

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发表于 Post on 2025-3-24 08:33:41 | 只看该作者 Only view this author
Teresa 发表于 2025-3-23 22:02
非常感谢您,后续我会按您的建议做这个计算,只是现在这个计算级别是老师让我做的,所以我得先做一次计算 ...

先学习F12相关理论,了解为什么基于cc-pVTZ-F12做F12计算,比基于cc-pVQZ做非F12计算好。然后跟你老师提一下。
你老师建议用CCSD(T)/cc-pVQZ可能只是因为你老师不知道F12,不一定是因为F12更差。不要你老师说啥就是啥
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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发表于 Post on 2025-3-24 10:20:57 | 只看该作者 Only view this author
CCSD(T)/cc-pVQZ算你这个体系根本没戏(都根本不是时间长短的问题,就是完全没戏)。本身这个级别耗时就极高,再加上Ti那么重的原子那么多,能算成功就新鲜了。必须换其它的计算级别。不要在缺乏常识的情况下盲目冲高精度,否则在瞎折腾上会轻易白浪费几个月时间。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-24 10:46:40 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-3-24 08:33
先学习F12相关理论,了解为什么基于cc-pVTZ-F12做F12计算,比基于cc-pVQZ做非F12计算好。然后跟你老师提 ...

我明白啦老师,我会去学习然后和老师商量一下,再次感谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-24 10:49:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-24 10:20
CCSD(T)/cc-pVQZ算你这个体系根本没戏(都根本不是时间长短的问题,就是完全没戏)。本身这个级别耗时就极 ...

谢谢老师,因为这部分没有论文做参考,我以为精度越高越有参照性和说服力,结果算了这么久,感觉荒废了时间

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发表于 Post on 2025-3-24 12:39:00 | 只看该作者 Only view this author
Teresa 发表于 2025-3-24 10:49
谢谢老师,因为这部分没有论文做参考,我以为精度越高越有参照性和说服力,结果算了这么久,感觉荒废了时 ...

才发现你没开DLPNO。开DLPNO的情况下是可以算得动的,但是还是那句话,用F12搭配cc-pVTZ-F12更好,计算量更低,精度更高,不用做counterpoise
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-24 12:46:20 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-3-24 12:39
才发现你没开DLPNO。开DLPNO的情况下是可以算得动的,但是还是那句话,用F12搭配cc-pVTZ-F12更好,计算量 ...

因为一开始是打算使用CCSD(T)方法,在论坛上看到说开了DLPNO之后和CCSD(T)方法就不是一个东西了。
我现在就开始使用F12,后续计算完成后再向您请教,非常感谢老师。

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发表于 Post on 2025-3-24 18:06:54 | 只看该作者 Only view this author
Teresa 发表于 2025-3-24 12:46
因为一开始是打算使用CCSD(T)方法,在论坛上看到说开了DLPNO之后和CCSD(T)方法就不是一个东西了。
我现 ...

不完全是一个东西,但差别很小,一般在1~2 kcal/mol以内
Zikuan Wang
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Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-25 16:38:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-3-24 12:39
才发现你没开DLPNO。开DLPNO的情况下是可以算得动的,但是还是那句话,用F12搭配cc-pVTZ-F12更好,计算量 ...

老师我在了解F12时,在ORCA手册上看到cc-pVTZ-F12可用元素为H–Ar,包括其辅助基集也是到Ar,但是我的体系是Ti,这样也可以使用吗

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发表于 Post on 2025-3-25 18:18:17 | 只看该作者 Only view this author
Teresa 发表于 2025-3-25 16:38
老师我在了解F12时,在ORCA手册上看到cc-pVTZ-F12可用元素为H–Ar,包括其辅助基集也是到Ar,但是我的体 ...

那就选用文献里支持Ti的F12基组。如果实在没有,用aug-cc-pVTZ。aug-cc-pVXZ和cc-pVXZ-F12(X=D,T,Q)差不多大,一定程度上可以通用
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-26 12:47:41 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-3-25 18:18
那就选用文献里支持Ti的F12基组。如果实在没有,用aug-cc-pVTZ。aug-cc-pVXZ和cc-pVXZ-F12(X=D,T,Q)差 ...

老师您好,我查看了相关文献和ORCA手册,发现所有的F12基组都只使用到Ar以及其他一些元素,不涉及过渡金属,所以我现在就采用了aug-cc-pVTZ,我的输入文件为
! CCSD(T) aug-cc-pVTZ  tightSCF noautostart miniprint
! NoTRAH
%maxcore     3000
%pal nprocs   40 end
* xyz   0   6
Ti     0.52110186    0.11889480    0.09456427
Ti     1.59841912    2.28375665   -0.83047139
Ti    -0.84051084    2.31446306    0.51074888
Ti    -0.59732847    1.34517173   -1.96581057
Ti    -2.09809666    0.03480885   -0.01813699
Ti     1.75772708   -0.01907120   -2.19228759
Ti     1.46939454    1.66327692    1.90078577
Ti     3.12436797    0.08982412    0.07275700
Ti     1.57853288   -1.13341671    2.09721151
Ti     1.74522964   -2.12763111   -0.38498059
Ti    -0.61704707   -2.09997290    0.98133588
Ti    -0.85323750    0.20180149    2.31819566
Ti    -0.52312971   -1.47025422   -1.76208672
Na     1.80806481   -3.01869348   -3.55336724
*
在运行后会有警告信息:
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 80 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (74.1% vs. 18.9%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 81 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (67.8% vs. 26.1%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 82 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (72.6% vs. 20.6%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 83 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (84.5% vs. 17.9%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 103 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (88.4% vs. 11.6%)
MOs in valence range (operator=0) identified as core or semicore orbitals.
Attempting to correct this by swapping MOs:
                           MOs 118 and 79
                                               done
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 80 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (74.1% vs. 18.9%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 81 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (67.8% vs. 26.1%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 82 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (72.6% vs. 20.6%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 83 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (84.5% vs. 17.9%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 103 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (88.4% vs. 11.6%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 80 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (74.1% vs. 18.9%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 81 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (67.8% vs. 26.1%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 82 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (72.6% vs. 20.6%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 83 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (84.5% vs. 17.9%)
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 103 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (88.4% vs. 11.6%)
MOs in valence range (operator=1) identified as core or semicore orbitals.
Attempting to correct this by swapping MOs:
                           MOs 118 and 79
                                               done
                                        WARNING
Check your MOs and check whether a frozen core calculation is appropriate
MO 80 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (74.1% vs. 18.9%)
                                        WARNING
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MO 81 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (67.8% vs. 26.1%)
                                        WARNING
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MO 82 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (72.6% vs. 20.6%)
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MO 83 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (84.5% vs. 17.9%)
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MO 103 should be a Ti p semi-core orbital but seems to be delocalized with a Ti s orbital (88.4% vs. 11.6%)
请问老师这个有影响吗

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发表于 Post on 2025-3-26 12:51:49 | 只看该作者 Only view this author
Teresa 发表于 2025-3-26 12:47
老师您好,我查看了相关文献和ORCA手册,发现所有的F12基组都只使用到Ar以及其他一些元素,不涉及过渡金 ...

检查是否有基组线性相关问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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