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[Multiwfn使用咨询] 计算“原子的静电势”中C原子的数据缺失,该如何获得?

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各位老师好,我想计算乙醇分子中C原子的“原子静电势”,按照Sob老师分享的博文《谈谈怎么计算化学体系中“原子的静电势”》(http://bbs.keinsci.com/thread-29998-1-1.html))中第2点: 原子局部范德华表面的静电势平均值 进行了计算,发现代表C原子的1、2号原子数据缺失(如图乙醇所示),请问这是因为CH2、CH3中的C原子被严重包埋而没有对应的局部范德华表面吗? 那如果想要计算亚甲基CH2、甲基CH3中C原子的静电势,还有什么办法可以计算吗?感谢各位老师解惑!





ps:我计算了sob老师提供的示例——丙烯醛的原子静电势(如图丙烯醛所示), 发现丙烯醛中的C原子确实可以计算出来的,说明操作过程无误,那丙烯醛中的C原子能计算出来是因为丙烯醛是类似于平面的结构吗?《原子局部范德华表面的静电势平均值》计算方法是否不适用于计算含烷基链的分子?


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发表于 Post on 2025-3-29 23:21:04 | 只看该作者 Only view this author
文中写得非常明白:
还值得一提的是,那些被严重包埋的原子是没有对应的局部范德华表面的。比如C60富勒烯里包夹一个小分子,此时范德华表面完全在C60的外表面上,被包夹的小分子的原子对范德华表面没有任何贡献,也因此不可能对这些原子计算局部范德华表面上的信息。对这些原子,Multiwfn在输出以上信息时是直接略过的。
Multiwfn的输出里也提示得没法更清楚:

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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-30 10:08:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-29 23:21
文中写得非常明白:
Multiwfn的输出里也提示得没法更清楚:

收到,感谢老师解答。

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