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本帖最后由 NicoleDH 于 2025-3-30 15:45 编辑
大家好,
我正在用Gaussian09做一个轴手性化合物的旋转能垒计算,该化合物有两个芳香平面通过手性轴连接而成。我想计算从A构象到B构象的旋转能量和半衰期。
通过对A的优化构象进行二面角扫描后,我选取了能量最高的点作为初猜过渡态结构,柔性扫描的关键词如下:
# opt=modredundant B3LYP/6-31G(d,p) scf=tight int=ultrafine
...
D 5 6 14 27 S 36 10.0
将初猜过渡态结构(TS_guess)做优化,关键词如下。虽然正常计算完毕,也收敛了,只有一个虚频,但是虚频的震动方向并不是手性轴的转动方向,而是一个基团上氢原子的转动。
检查优化后的初猜过渡态(TS_guess_opt),发现TS_guess_opt与TS_guess的二面角差别比较大,而与A却很接近。
# opt=(ts,calcfc,noeigen) freq B3LYP/6-31G(d,p) scf=tight int=ultrafine
请教大家:
1. 二面角扫描的曲线为什么不够平滑?扫描这一步就出问题了吗?
2. 虚频的震动方向不是手性轴的转动方向这个问题该如何解决?我看社长的帖子里说,可能是初猜TS结构不合理或者计算级别不合适。我选的TS_guess中两个芳环平面基本上是平行的,两个围绕轴转动肯定会有这个中间态的。
3. 我还拿能量第二高的点作过初猜过渡态结构,做一样的优化,但出现了一样的问题。
看了社长的帖子,应该暂时没必要做QST2寻找过渡态。
非常感谢!
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