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[新手求助] 为什么用高斯和VMD导出的homo lumo轨道有点不一样呢?主要是成键方面的

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本帖最后由 哈哈哈哈哈aaa 于 2025-4-9 10:04 编辑

想请各位老师帮忙看一下,是根据文献中这个ESP图建模的,以下是我的高斯和VMD导出的homo lumo图,我希望VMD导出也和高斯效果一样,不要有这 Zr.tif (271.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 2) 种游离的OH形式

图片2.png (163.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

图片2.png

图片1.png (76.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

图片1.png

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发表于 Post on 2025-4-9 10:18:38 | 只看该作者 Only view this author
不过是个显示问题而已,自行参考http://sobereva.com/534修改VMD的键连关系即可。另外如果这里的金属原子真是Zr的话可能配位数偏小了,在你上一帖http://bbs.keinsci.com/thread-52705-1-1.html已经讲过这个问题。

也不知道你拿HOMO或LUMO轨道等值面图要讨论什么,请仔细阅读http://sobereva.com/543以及之前一个提问帖http://bbs.keinsci.com/thread-52637-1-1.html下面的回答,以及http://sobereva.com/380第一段。
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-9 11:05:49 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-9 10:18
不过是个显示问题而已,自行参考http://sobereva.com/534修改VMD的键连关系即可。另外如果这里的金属原子真 ...

老师,但为什么我看有些文献也是按照6配位来画的呢

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发表于 Post on 2025-4-9 11:30:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-4-9 11:47 编辑
哈哈哈哈哈aaa 发表于 2025-4-9 11:05
老师,但为什么我看有些文献也是按照6配位来画的呢

没有具体文献没法说,毕竟不同作者写的质量不一,要么水平高的做过严谨的实验表征和计算模拟确认在特定环境下特定Zr的物种就是那样配位,要么水平低的连经典书本上都有的Zr的元素化学知识都不具备就随便参考半径更小的Ti建模了……自己的研究当然不能尽信文献,也不能不带无机化学常识。

编辑:不知道你有没有看到这篇计算文章,虽然基组不算很好但至少结构是对的
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-9 15:01:14 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-9 11:30
没有具体文献没法说,毕竟不同作者写的质量不一,要么水平高的做过严谨的实验表征和计算模拟确认在特定环 ...

好的好的 谢谢老师!!

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