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[CP2K] 求助CP2K输出动力学的Wannier信息

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....


[管理员注:原贴内容后来被楼主自己改没了]

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发表于 Post on 2025-4-9 23:25:28 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “CP2K输出信息” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。

我不知道你的目的是什么,CP2K的轨道定域化往往表现得不稳健。用Multiwfn载入CP2K输出的molden文件,按下文做轨道定域化(对周期性体系等同于产生最大定域化Wannier函数),同样可以产生定域化轨道的中心位置
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380http://bbs.keinsci.com/thread-6053-1-1.html
详谈使用CP2K产生给Multiwfn用的molden格式的波函数文件
http://sobereva.com/651http://bbs.keinsci.com/thread-31827-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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傻傻的木瓜

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发表于 Post on 2025-4-9 23:58:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-4-10 14:28 编辑
sobereva 发表于 2025-4-9 23:25
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

或许楼主想通过分子动力学结合TRAVIS获得红外光谱,所以即使是三个水分子也尝试拿CP2K在15埃盒子里做周期性计算……这算不算少数不适合拿ORCA跑小型孤立体系AIMD的场合呢?在ORCA论坛搜TRAVIS也没看到多少讨论(倒是有一个又聊回了CP2K),不知道ORCA现在有没有方便的接口或者至少是能输出相关的文件。

编辑:1楼内容不知为何被编辑掉了,原来楼主是希望CP2K输出动力学的“轨迹、Wannier信息和Voronoi信息”,我是搜索这几个关键词才产生的对计算目标的猜想。
√546=23.36664289109

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发表于 Post on 2025-4-10 00:27:49 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-9 23:58
或许楼主想通过分子动力学结合TRAVIS获得红外光谱,所以即使是三个水分子也尝试拿CP2K做周期性计算……这 ...

动力学产生红外光谱是很简单的事,TRAVIS完全不是唯一能用的。实际上在北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)里演示的单分子做AIMD获得红外光谱的例子,用的也是其它的工具(calc-ir-spectra.py脚本。这种小脚本/程序在网上多的是)。只要动力学过程中能给出每一帧的偶极矩信息,都可以用这个python脚本或网上很多类似的脚本/程序产生红外光谱,用ORCA跑AIMD也一样。三个水跑动力学获得红外光谱的目的我会优先用ORCA跑

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发表于 Post on 2025-4-10 14:39:34 | 只看该作者 Only view this author
由于帖子标题被作者改成了莫名其妙的“...”,导致别人无法根据帖子主题看到他人有价值的回帖,我重新编辑了贴子标题

顺带提醒楼主,别胡乱改帖子标题。下次再这样扣分处理。
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