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[CP2K] CP2K做CI-NEB能量如何监控?

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本帖最后由 THY 于 2025-4-23 17:25 编辑

请问使用CP2K做CI-NEB的时候,如何监测能量收敛过程,从而画出能量收敛曲线,考虑到每个CI-NEB插点数目不同,有没有什么办法可以忽视插点数目,而直接读取整个NEB的能量变化呢?

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发表于 Post on 2025-4-23 18:41:43 | 只看该作者 Only view this author
如果你指整条NEB的总能量,用grep把输出文件里的能量那行提出来就完了
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发表于 Post on 2025-4-24 08:50:10 | 只看该作者 Only view this author
需要安装gnuplot,运行:
  1. plot for [i=2:9] 'NEB-1.ener' u 1:i w lp t ''.i
复制代码

这里假设你有8个NEB的副本,for循环的变量i范围便设置为了2~9,输出的图中监控了每个副本的能量变化。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-25 10:56:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-23 18:41
如果你指整条NEB的总能量,用grep把输出文件里的能量那行提出来就完了

谢谢老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-25 10:56:57 | 只看该作者 Only view this author
丁越 发表于 2025-4-24 08:50
需要安装gnuplot,运行:

这里假设你有8个NEB的副本,for循环的变量i范围便设置为了2~9,输出的图中监控 ...

谢谢老师!

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