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[GROMACS] 求助,审稿人让补Heterogeneity order parameter (HOP)数据,请问怎么计算得到

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这是审稿人的意见,体系是离子液体

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发表于 Post on 2025-4-23 21:38:18 | 只看该作者 Only view this author

根据公式,可以先计算出N和σ,N应该就是体系内定义的粒子数,然后选择合适对的gmx tools算出rij,接着用Excel或者写个code算出HOP。
不知道有没有大神有现成的code可以用的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-23 23:29:30 | 只看该作者 Only view this author
莫落 发表于 2025-4-23 21:38
根据公式,可以先计算出N和σ,N应该就是体系内定义的粒子数,然后选择合适对的gmx tools算出rij,接着用 ...

好的 我去试试 谢谢大佬!!!

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