cp2k计算时出现报错MPI_ABORT was invoked on rank 25 in communicator MPI_COMM_W...

生煎小馒头

在集群上使用cp2k2025.1版本计算的时候出现报错MPI_ABORT was invoked on rank 25 in communicator MPI_COMM_WORLD，用的是slurm提交作业，一提交就出现这个报错，有遇见相同问题的吗？
lr.inp是输入文件，lr.out是输出文件，92520.err和92520.out是作业调度系统生成的输出和错误日志

maoxinxina

检查一下构型吧。 *** WARNING in particle_methods.F:677 :: The distance between the atoms ***
*** 222 and 234 is only 0.183 angstrom and thus smaller than the        ***
*** threshold of 0.500 angstrom                                         ***


*** WARNING in particle_methods.F:677 :: The distance between the atoms ***
*** 283 and 294 is only 0.183 angstrom and thus smaller than the        ***
*** threshold of 0.500 angstrom                                         ***

Uus/pMeC6H4-/キ

这个Ga7In5N12与BiVO4的异质结结构γ角才2.7度、a和b达到七八十埃，过于扁平细长了，不仅不便于观看也很难检查周期镜像之间有没有原子异常接触。重新建模最好，可以把初始结构文件传上来，并讲讲产生当前结构的具体操作 。