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[Lammps] lammps联用PLUMED计算RMSD时第0帧不为0

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ljh123

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发表于 Post on 2025-4-26 17:04:12 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
附件已上传。我对比了参考结构和输入结构坐标，应该是一一对应的。也尝试过计算不同原子组的RMSD，但是第0帧均不为0。我之前也计算过类似体系，没有出现过这种情况。请问下大家改如何处理呢。 input.plumed (288 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 6) conf.lmp (62.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 2) POSCAR2_surf.pdb (909 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1)
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