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[Gaussian/gview] 高斯使用广义内坐标(GIC)进行柔性扫描,输入文件书写问题

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楼主
本帖最后由 chemcomputezzu 于 2025-4-29 18:11 编辑

老师同学们好,打扰了,我想请教一个问题。我想对我这个体系的29,32号原子中心与30号原子的距离进行柔性扫描,我使用了http://sobereva.com/474中的第六部分广义内坐标(GIC)扫描,可能我这样写是错的,导致得到的结果是30号原子分别与29,32号原子进行扫描且最后报错没有收敛。希望老师能指正一下该如何达到对这个体系的29,32号原子中心与30号原子的距离进行柔性扫描的目的。

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发表于 Post on 2025-4-29 20:33:16 | 只看该作者 Only view this author
“报错没有收敛”是指几何优化不收敛(http://sobereva.com/164)还是SCF不收敛(http://sobereva.com/61)?
如果最终目的是为了找过渡态,柔性扫描不是唯一的摆初猜结构的方法,不妨直接把输入输出文件作为附件上传并说明是什么反应()
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-29 21:44:42 | 只看该作者 Only view this author
不好意思各位老师,这是报错信息以及输入文件,输出文件太大不好上传,只截取了报错信息。所得到的扫描曲线是这个样子,我想证明这个反应是一个二分势能面,所以扫描29与32号原子几何中心与30号原子的距离,扫描曲线一个2个点相近的平台是分别对29与30,32与30号原子的距离进行了扫描。

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gic.gjf

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发表于 Post on 2025-4-29 23:21:17 | 只看该作者 Only view this author
酯基alpha位碳正离子这个中间体是怎么来的,确认产生碳正离子和对苯环加成是两步而不是一步么?

“证明反应是一个二分势能面”当然要从找(VRI点之前的)过渡态开始,其实又回到我上面说的第二句话了……优化过渡态并不一定要求先做柔性扫描,而可以直接对摆得比较好的初猜结构用下述关键词:
#p opt(calcfc,ts,noeigen) freq b3lyp/6-31g(d) em=gd3bj
其中添加了必要的D3(BJ)色散校正,去掉了不必要的guess和pop关键词。如果难以优化到过渡态,还有http://sobereva.com/164的众多解决方法。
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-30 09:23:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chemcomputezzu 于 2025-4-30 11:00 编辑

老师您好,谢谢指导,我先按您的方法试试

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