Error: Bad topology file.

15whyhq · 发表于 Post on 2017-3-16 19:36:17

建完盒子生成.inpcrd .prmtop 文件之后，最小化也结束了，但是跑动力学的时候 md.log 文件出现如下错误提示：
Error: Bad topology file. Sum of ATOMS_PER_MOLECULE does not equal NATOM.
top文件有问题应该怎么解决呢？谢谢！

哪哪哪 · 发表于 Post on 2019-8-27 07:15:52

你好，我在用AMBER动力学时也遇到了同样的问题，方便分享一下怎样解决的吗？万分感谢

musaxisuoke · 发表于 Post on 2023-1-12 00:40:54

哪哪哪发表于 2019-8-27 07:15
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请问您解决这个问题了吗？我也遇到该问题了貌似跟ntb和ntp的设置有关

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[Amber] Error: Bad topology file.