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[新手求助] 低自由度分子S1态优化不收敛

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本帖最后由 czjtry 于 2025-5-10 20:30 编辑

各位老师,我使用#p B3LYP/6-31G(d,p) TD(Root=1) opt和S0优化结构作为输入,优化一个简单且稳定的分子的S1的几何结构,但始终处于opt和scf不收敛状态,

尝试了#p B3LYP/6-31G(d,p) TD(Root=1) opt(gdiis,maxstep=3,notrust,recalc=3),#p opt tda cam-b3lyp/6-31g(d,p), 最后尝试#p opt tda cam-b3lyp/6-31g(d,p) SCF(novaracc,noincfock)输出,
发现优化过程中会有原子距离过近的状态,请问还可以怎么去完成S1的优化呢

附件为S0优化的结构SNMI-S1-opt.gjf和同类分子S1优化后截取出这个分子部分优化SNMI-S1-opt-3.gj


微信图片_20250510155149.png (159.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

微信图片_20250510155149.png

Snipaste_2025-05-10_15-50-56.png (6.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

Snipaste_2025-05-10_15-50-56.png

SNMI.rar

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发表于 Post on 2025-5-10 23:37:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wal 于 2025-5-10 23:43 编辑

你的第一个计算文件在第6步的时候梯度飞了,随后振子强度突然走低,感觉是B3LYP低估了某电荷转移态能量,随后follow歪了,最后跟着ghost态走到了一个本来不应该有的圆锥交叉

用你的初始结构换cam-B3LYP-d3bj/6-31g*,8步收敛,看起来一切正常。 SNMI-S1-opt-3.zip (256.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)


S1振子强度挺高的,跟原先疑似走歪的近0振子强度大相径庭。S3这个电荷转移态看着有点可疑,可能是follow它最后follow到圆锥交叉里去了


这也是我面对陌生体系算激发任务不习惯B3LYP or PBE0的原因。。一不小心follow到ghost态可能就不知道给你带哪去了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-10 16:10:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 czjtry 于 2025-5-10 21:10 编辑

输出文件压缩

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发表于 Post on 2025-5-10 16:32:05 | 只看该作者 Only view this author
看了一下你的输入输出文件。之前我在QQ群里说你的结构有问题、多了一个环,但现在看了一下,你的结构没有问题,只是优化过程中它自动成环了。
我给你这几个建议吧:
(1)优化过程中确实应该成环吗?回答这个问题要知道激发态的电子结构是怎样的(激发是局限在酰亚胺官能团内,还是从苯环跃迁到酰亚胺,等)。建议先用两个环离得远的结构算一个 TD 单点,观察一下激发态的电子结构。
(2)现在的报错是 SCF 难以收敛,这与 opt 无关,建议把 opt(gdiis,maxstep=3,notrust,recalc=3) 括号里的全删掉,只保留 opt 即可。

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现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2025-5-10 17:02:40 | 只看该作者 Only view this author
输出文件显示,优化到最后,激发能只有0.0几电子伏特了,说明出现了S0/S1势能面交叉。这是几何优化振荡和SCF不收敛的主要原因。此时不能用TDDFT了。可以尝试CAS或MRSF-TDDFT,但是它们的使用细节颇有讲究,而且不能用高斯做。

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发表于 Post on 2025-5-10 17:56:37 | 只看该作者 Only view this author

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,导致信息零零碎碎,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2025-5-10 21:08:18 | 只看该作者 Only view this author
这有点抽象,看起来不像是我熟悉的那种容易走圆锥交叉的分子

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发表于 Post on 2025-5-10 21:21:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Stardust0831 于 2025-5-10 21:36 编辑
wal 发表于 2025-5-10 21:08
这有点抽象,看起来不像是我熟悉的那种容易走圆锥交叉的分子

我也觉得。有可能是结构不合理而导致的问题,我这边正在尝试算他这个。有结果了会发。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-10 22:08:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-10 17:56
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,导致信息零零碎碎, ...

不好意思sob老师,潜水至今第一次发,忘记规矩了,已更正,谨以为戒orz

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-10 22:09:54 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2025-5-10 17:02
输出文件显示,优化到最后,激发能只有0.0几电子伏特了,说明出现了S0/S1势能面交叉。这是几何优化振荡和SC ...

谢谢free老师,这个情况我还没见过,感谢free老师解惑,我也去学习一下CAS试试能不能解决这个问题

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发表于 Post on 2025-5-10 22:48:59 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2025-5-10 17:02
输出文件显示,优化到最后,激发能只有0.0几电子伏特了,说明出现了S0/S1势能面交叉。这是几何优化振荡和SC ...

我和朋友讨论了一下。觉得不应该只看到激发能小,还应该注意到S1的振子强度非常之小,有ghost态的嫌疑。

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发表于 Post on 2025-5-11 01:05:40 | 只看该作者 Only view this author
我也来交作业啦,wal佬用的是CAM-B3LYP,这是我用wB97XD计算出来的结果,与他的结果相近。


SNMI-S1-opt-stardust0831.zip

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-11 12:11:50 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-5-10 23:37
你的第一个计算文件在第6步的时候梯度飞了,随后振子强度突然走低,感觉是B3LYP低估了某电荷转移态能量,随 ...

谢谢w老师,狠狠学习辽,我是实验组自学的计算,类似的这种有机小分子我一直是使用b3lyp/6-31G**,那激发任务您一般推荐是使用哪个呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-11 12:12:40 | 只看该作者 Only view this author
Stardust0831 发表于 2025-5-11 01:05
我也来交作业啦,wal佬用的是CAM-B3LYP,这是我用wB97XD计算出来的结果,与他的结果相近。

谢谢Stardust老师!ღ( ´・ᴗ・` )

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发表于 Post on 2025-5-11 12:28:19 | 只看该作者 Only view this author
czjtry 发表于 2025-5-11 12:11
谢谢w老师,狠狠学习辽,我是实验组自学的计算,类似的这种有机小分子我一直是使用b3lyp/6-31G**,那激发 ...

建议cam-B3LYP-D3BJ起手,这也是我的习惯。如果发现感兴趣的态是LE激发,高估激发能太厉害,此时用已收敛结构切换PBE0 B3LYP之类的重新算也不会如从头开始算那样耗时很久。
也可以考虑wb97xd,这个泛函跟cam-B3LYP算电荷转移效果差不多,但我个人不是很喜欢这个泛函,体感算柔性体系容易印刷虚频。

PS:我也是实验组自学计算哈哈

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