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[新手求助] [Zr4(OH)8(H2O)16]8+建模电荷设置问题

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目前打算按照这篇文献里锆8配位进行建模,但文献里结构式为[Zr4(OH)8(H2O)16]8+带8个正电荷
1、我的吸附剂等电点是4.1,吸附实验在pH=7下做的,应该按照带负电画,那是不是有些配位的水分子可以改成OH?

2、但我体系带几个负电荷是可以随意设置的吗?

3、按照带负电绘制完成后,是否还需要按照电中性,加入相应电荷数的抗衡离子?

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发表于 Post on 2025-5-22 20:27:59 | 只看该作者 Only view this author
1、我的吸附剂等电点是4.1,吸附实验在pH=7下做的,应该按照带负电画,那是不是有些配位的水分子可以改成OH?

2、但我体系带几个负电荷是可以随意设置的吗?
每去掉一个氢离子,电荷数就-1
3、按照带负电绘制完成后,是否还需要按照电中性,加入相应电荷数的抗衡离子?
你的文献好像没有发出来,我可能不太好回答
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-22 20:42:04 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2025-5-22 20:27
1、我的吸附剂等电点是4.1,吸附实验在pH=7下做的,应该按照带负电画,那是不是有些配位的水分子可以改成OH ...

老师,是这一篇10.1021/acs.inorgchem.1c02078
那比如我可以设置电荷为-1 尝试计算吗?

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发表于 Post on 2025-5-22 20:45:38 | 只看该作者 Only view this author
哈哈哈哈哈aaa 发表于 2025-5-22 20:42
老师,是这一篇10.1021/acs.inorgchem.1c02078
那比如我可以设置电荷为-1 尝试计算吗?

我觉得比较严格的做法是算一下pKa。可以看一下:http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 5&fromuid=19420
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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