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[VASP] VASP几何优化时为什么甲醇分子会断键

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VASP几何优化时为什么甲醇分子会断键,我是在石墨烯片层上面搭建了两层Pt111面,做完几何优化了,然后在这基础上加入甲醇分子,尝试了几种放置位置,发现甲醇分子的中C的一个H会跑掉,这是什么情况?

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发表于 Post on 2025-5-22 21:15:00 | 只看该作者 Only view this author
C-H靠近Pt,可能在优化时Pt原子吸引H,导致键断裂。试一试让O-H朝向表面,让O与Pt形成较强的相互作用,而C-H远离表面,减少被催化的可能性。(本人小白,不成熟的见解)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-22 21:21:06 | 只看该作者 Only view this author
wilesyu 发表于 2025-5-22 21:15
C-H靠近Pt,可能在优化时Pt原子吸引H,导致键断裂。试一试让O-H朝向表面,让O与Pt形成较强的相互作用,而C- ...

我之前是将甲醇分子C=O横着放,结果优化完C=O直接断掉了,然后我把垂直放,C靠近Pt表面结果H又跑掉了

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发表于 Post on 2025-5-22 22:06:43 | 只看该作者 Only view this author
hbw 发表于 2025-5-22 21:21
我之前是将甲醇分子C=O横着放,结果优化完C=O直接断掉了,然后我把垂直放,C靠近Pt表面结果H又跑掉了

可以提供一下POSCAR文件么

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发表于 Post on 2025-5-23 09:32:12 | 只看该作者 Only view this author
软件的显示问题,社长写过一篇判断成键的博文,可以看看
愿艾欧尼亚之灵指引你。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-23 09:58:49 | 只看该作者 Only view this author
wilesyu 发表于 2025-5-22 22:06
可以提供一下POSCAR文件么

POSCAR和CONTAR都在这里,明显CONTCAR有个C-H键很远

POSCAR

8.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

CONTCAR

11.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-23 10:01:43 | 只看该作者 Only view this author
Lance先生 发表于 2025-5-23 09:32
软件的显示问题,社长写过一篇判断成键的博文,可以看看

但是我横着放甲醇时,是直接跑开很远的,可以看出是断键了

屏幕截图 2025-05-23 100045.png (23.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

屏幕截图 2025-05-23 100045.png

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发表于 Post on 2025-5-23 15:20:34 | 只看该作者 Only view this author
你这个不是Pt(111)面,而是2层Pt原子,建立异质结可以用vaspkit构建。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-23 15:55:28 | 只看该作者 Only view this author
archer 发表于 2025-5-23 15:20
你这个不是Pt(111)面,而是2层Pt原子,建立异质结可以用vaspkit构建。

这是我切的Pt111面,然后跟着石墨烯基底一起几何优化的,然后就成下面这个样子了

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发表于 Post on 2025-5-23 16:26:27 | 只看该作者 Only view this author
hbw 发表于 2025-5-23 15:55
这是我切的Pt111面,然后跟着石墨烯基底一起几何优化的,然后就成下面这个样子了

不同晶面不能直接放一起,需要扩胞使得晶格参数匹配,然后放一起

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-23 19:06:47 | 只看该作者 Only view this author
archer 发表于 2025-5-23 16:26
不同晶面不能直接放一起,需要扩胞使得晶格参数匹配,然后放一起

我是用MS建的模型,然后复制的,对于您说的是异质结的构建,我确实不知道该怎么去晶格匹配,之前尝试过,结果Pt都跑盒子边缘上,还请您不吝赐教

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