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[综合交流] 现在的学生真是不得了(PM3分析轨道系数不靠谱啊)

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本帖最后由 ggdh 于 2017-3-21 19:15 编辑

今天上课讲到α-β不饱和醛酮的共轭加成

讲到,因为LUMO在β位系数较大。而在羰基碳上系数较小。所以轨道作用为主的软碱进攻β位,而静电作用成分比较多的硬碱进攻羰基碳。
结果下课就有个学生,拿着ipad上来跟我说”我刚算了这个分子的LUMO,感觉羰基碳上的分布好像还大一点啊“ 然后把他算的轨道给我看。
我一看,我去,原来ipad还可以提交到MOPAC服务器上算轨道。我真是长知识了。
别人好歹是pm3算的,比我这个Huckel规则算的方法还高级一点。。。
我也是服气。只有等下课用B3LYP算算看了。。

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发表于 Post on 2017-3-21 00:39:29 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP结果怎样呢?这种分子如果Huckel的参数是经过类似分子验证的话,说不定还好过PM3。。。

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给大佬倒茶

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发表于 Post on 2017-3-21 08:56:11 | 只看该作者 Only view this author
了不得啊了不得,老师你赶紧拽住他跟他学习怎么用iPad提交的~
人丑就该多读书,嘴拙最好少说话。
行百里者半九十,戒骄戒躁。

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发表于 Post on 2017-3-21 08:57:07 | 只看该作者 Only view this author
学生主动学习意识强是好事,可以拉来做计算 哈哈

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发表于 Post on 2017-3-21 09:18:49 | 只看该作者 Only view this author
这是本科课程还是研究生课程啊,这学生好厉害
Stand on the shoulders of giants

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密度泛函·小卒

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发表于 Post on 2017-3-21 09:32:12 | 只看该作者 Only view this author
呵呵,这样的娃娃很合适啊,抓紧时间拉进课题组嘛!
一出生响亮登场,十几岁快乐成长,
二十岁天天向上,三十岁基本定向,
四十岁拼命打创,五十岁回首一望,
六十岁告老还乡,七十岁搓搓麻将,
八十岁躺在床上,九十岁挂在墙上,
人生一世,匆匆忙忙,生得嘹亮,走得凄凉!
生活就像五味瓶,酸甜苦辣难消停!
该吃吃,该喝喝,遇事别去心里搁,
想哭哭,想笑笑,烦恼就往云外抛,
记住甜,忘掉苦,亲人朋友好相处,
心情好,最重要,自我麻痹乐逍遥!

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发表于 Post on 2017-3-21 10:13:51 | 只看该作者 Only view this author
yjcmwgk 发表于 2017-3-21 09:32
呵呵,这样的娃娃很合适啊,抓紧时间拉进课题组嘛!

这是在说我吗?

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发表于 Post on 2017-3-21 14:39:03 | 只看该作者 Only view this author
元江1994 发表于 2017-3-21 08:56
了不得啊了不得,老师你赶紧拽住他跟他学习怎么用iPad提交的~


应该是ssh连的服务器
当年把ipad越狱后也通过ssh向ipad传文件,甚至还能编译程序
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2017-3-21 16:27:21 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-3-21 17:04 编辑



B3LYP/6-31G(d), Hirshfield orbital composition (LUMO, MO 16)
  1. Atom     1(C ) :   29.096961%
  2. Atom     4(C ) :   15.746400%
  3. Atom     6(C ) :   23.765496%
  4. Atom     8(O ) :   22.371784%
复制代码

PM3 (at B3LYP/6-31G(d) geometry) (LUMO, MO 12)  竟然定性确实是不一样的
  1. Atom     1(C ) :   22.140898%
  2. Atom     4(C ) :   19.702170%
  3. Atom     6(C ) :   26.863879%
  4. Atom     8(O ) :   19.583873%
复制代码
PM6-D3
  1. Atom     1(C ) :   25.155926%
  2. Atom     4(C ) :   18.088675%
  3. Atom     6(C ) :   29.224179%
  4. Atom     8(O ) :   19.789193%
复制代码

图:
依次:B3LYP/6-31G(d), PM3


     


结论:PMx的波函数用于波函数分析不靠谱→_→
(不过没有确定Hirshfield的原子电子密度本身有没有关系,但肉眼看上去好像不只是)



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-21 19:08:55 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-3-21 16:27
B3LYP/6-31G(d), Hirshfield orbital composition (LUMO, MO 16)

PM3 (at B3LYP/6-31G(d) geometry) ...

哇!太感谢了!我还没来得及算呢。。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-21 19:14:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-21 14:39
应该是ssh连的服务器
当年把ipad越狱后也通过ssh向ipad传文件,甚至还能编译程序

https://www.webmo.net/
问了下,是连的这个网站算的。能够支持ios和android。这样拿着手机也能看个小分子轨道,静电势什么的。方便啊。

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发表于 Post on 2017-3-21 20:23:16 | 只看该作者 Only view this author
ggdh 发表于 2017-3-21 19:08
哇!太感谢了!我还没来得及算呢。。

嘿嘿嘿只是好奇

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发表于 Post on 2017-4-17 18:11:21 | 只看该作者 Only view this author
手机也能连 何必ipad

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发表于 Post on 2017-4-18 06:11:19 | 只看该作者 Only view this author
话说PMx这样的半经验法算小体系在移动设备上直接算也能算得动吧,有没有不需要联网的app?

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发表于 Post on 2017-4-23 20:45:56 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-3-21 16:27
B3LYP/6-31G(d), Hirshfield orbital composition (LUMO, MO 16)

PM3 (at B3LYP/6-31G(d) geometry) ...

李老师的意思是不是b3lyp更可靠呢?比如,这个体系的合理结果是alpha位被进攻呢还是beta位被进攻呢?
一般是通过将PMx与b3比较来得出PMx结果是否合理的吗?
谢谢

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