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[Multiwfn使用咨询] Multiwfn绘制RDG等值面求助

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我想用VMD绘制图中区域的RDG等值面,先用Multiwfn在图中区域绘制散点图,输出函数1和函数2的格点文件,然后用VMD打开,但是那个box范围却不是之前设定的范围,而且RDG等值面只有一小块,不知道是哪里出现了问题。

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发表于 Post on 2017-3-23 11:03:28 | 只看该作者 Only view this author
vmd显示的box只是整个体系的box而已,你VMD显式的cube文件显然是已经正确编辑了,否则环中心会出现位阻;VMD显示的确实不如Multiwfn“顺滑”,感觉Multiwfn在显式时似乎会做额外的差值,所以如果要用VMD达到同样的效果可能要算更密的格点

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发表于 Post on 2017-3-23 11:23:48 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-3-23 11:03
vmd显示的box只是整个体系的box而已,你VMD显式的cube文件显然是已经正确编辑了,否则环中心会出现位阻;VM ...

也有可能是渲染器的问题
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发表于 Post on 2017-3-23 12:32:00 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2017-3-23 11:23
也有可能是渲染器的问题

(⊙o⊙)? 我做出来一直有楼主的图的感觉

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-23 15:50:51 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-3-23 11:03
vmd显示的box只是整个体系的box而已,你VMD显式的cube文件显然是已经正确编辑了,否则环中心会出现位阻;VM ...

非常感谢

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发表于 Post on 2017-3-23 16:15:58 | 只看该作者 Only view this author
VMD显示有问题,或者文件你没弄对。应当是对应的,比如



反正Multiwfn里你直接看到的盒子范围肯定是实际范围
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-28 09:06:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-23 16:15
VMD显示有问题,或者文件你没弄对。应当是对应的,比如

老师你好,像这种RDG等值面上下两面的颜色的有差别是什么原因?

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发表于 Post on 2017-3-28 09:42:45 | 只看该作者 Only view this author
zpk 发表于 2017-3-28 09:06
老师你好,像这种RDG等值面上下两面的颜色的有差别是什么原因?

因为RDG等值面本身有一定厚度,恰好在不同的两个面上sign(lambda2)rho的符号有所不同
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-28 11:15:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-28 09:42
因为RDG等值面本身有一定厚度,恰好在不同的两个面上sign(lambda2)rho的符号有所不同

谢谢老师

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