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[GROMACS] 加速稳定性实验利用分子动力学模拟时系综应该选择控压吗

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各位老师好,我在尝试药物分子和聚合物形成固体分散体的模拟(这里的mdp文件与下方mdp文件相似),获得了一个团聚在一起的结构后,扩大盒子,添加一定数量水分子,不会填满盒子,打算进行一步能量极小化后进行产生相模拟,但是mdp文件中不确定是否应该考虑控压,mdp文件中对于温度等设置是否还有其他问题,还请多多赐教。

prod.mdp

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发表于 Post on 2025-6-5 00:42:47 | 只看该作者 Only view this author
没理由不控压。不控压水的密度怎么自发调节合理
mdp没明显问题

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jxin + 4 谢谢

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