几何优化后分子结构由五元环变成六元环

wwwwwt · 发表于 Post on 2025-6-5 10:00:44

各位大神，我在对下面这个分子进行几何优化时，发现其结构由五元环变成六元环了，按理说是六元环更稳定，可是这个五元环的分子在专利中有报道，并且有CAS号，还是多家厂商售卖的黄金产品，这证明其五元环结构是稳定存在的，所以问问大家是不是我的计算上出问题了？
以下是几何优化后的图片与计算文件
初始结构：

P000024.gjf (1.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

几何优化后：

P000024.zip (272.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

wwwwwt · 发表于 Post on 2025-6-5 10:09:46

补充一下：我是希望获得五元环结构的HOMO/LUMO能量，所以做了几何优化+单点计算

sai77 · 发表于 Post on 2025-6-5 10:18:52

本帖最后由 sai77 于 2025-6-5 10:23 编辑

初始结构不合理，你要优化的是六价S，正四面体构型，没有孤对电子
你给的初始结构明显是有孤对电子占据顶点，那肯定优化出来四价S
把初始结构的两个S=O双键调整为跟C-S-O所在平面垂直，再重新优化

wwwwwt · 发表于 Post on 2025-6-5 14:27:15

sai77 发表于 2025-6-5 10:18
初始结构不合理，你要优化的是六价S，正四面体构型，没有孤对电子
你给的初始结构明显是有孤对电子占据顶 ...

牛13，解决了
请问你是如何判断有无孤对电子的？S=O与C-S-O平面垂直有什么说法吗？是为了构建正四面体构型吗？

wjc404 · 发表于 Post on 2025-6-5 14:30:22

wwwwwt 发表于 2025-6-5 14:27
牛13，解决了
请问你是如何判断有无孤对电子的？S=O与C-S-O平面垂直有什么说法吗？是为了构建正四面体构 ...

建议去看一下VSEPR理论。

18217265596 · 发表于 Post on 2025-6-5 15:03:43

wwwwwt 发表于 2025-6-5 14:27
牛13，解决了
请问你是如何判断有无孤对电子的？S=O与C-S-O平面垂直有什么说法吗？是为了构建正四面体构 ...

S一共6个价电子，两个成单键，两个配位给氧，哪来的孤电子对

wwwwwt · 发表于 Post on 2025-6-5 15:18:11

wjc404 发表于 2025-6-5 14:30
建议去看一下VSEPR理论。

ok

wwwwwt · 发表于 Post on 2025-6-5 15:18:57

18217265596 发表于 2025-6-5 15:03
S一共6个价电子，两个成单键，两个配位给氧，哪来的孤电子对

我也好奇啊，按理说没有孤电子对了，可能是我建模时S原子的价态选错了

sobereva · 发表于 Post on 2025-6-6 00:49:02

wwwwwt 发表于 2025-6-5 10:09
补充一下：我是希望获得五元环结构的HOMO/LUMO能量，所以做了几何优化+单点计算

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，导致信息零零碎碎，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

wwwwwt · 发表于 Post on 2025-6-6 09:20:33

sobereva 发表于 2025-6-6 00:49
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，导致信息零零碎碎， ...

明白卢皇

lushiyue · 发表于 Post on 2025-6-6 21:13:48

wwwwwt 发表于 2025-6-5 15:18
我也好奇啊，按理说没有孤电子对了，可能是我建模时S原子的价态选错了

显然成六元环的时候已经不是磺酰结构了，只用了4个价电子，剩下一对占据顶点

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