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[GROMACS] 如何从trr文件中提取某一组分的速度文件?

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Level 2 能力者

想请教一下大佬们,如何从trr文件中提取某一组分的速度信息,如何才能获得某一组分的整体平均速度?并且提取出来后有无相关脚本可以处理数据?

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Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2025-6-7 10:36:55 | 只看该作者 Only view this author
用traj命令-ov可以提取每个原子的速度到xvg文件中,再自己平均一下就行了
  1. gmx traj -s *.tpr -f *.trr -ov vel.xvg
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