如何考察并解释质子化诱导的断键？

wzkchem5

2877321934 发表于 2025-6-27 03:20
想额外请教老师一个问题，我使用AIMD跑多条轨线发现解离过程都是先从某一根键开始断，于是我又尝试使用柔 ...

合理。考虑两个反应，一个能量单调从0上升到10kcal/mol，另一个能量从0上升到15kcal/mol再下降到10kcal/mol。那么在其他因素相同的情况下，显然前者更容易，即便前者没有过渡态而后者有

2877321934

wzkchem5 发表于 2025-6-27 09:11
合理。考虑两个反应，一个能量单调从0上升到10kcal/mol，另一个能量从0上升到15kcal/mol再下降到10kcal/m ...

懂了，谢谢老师，不过为什么ΔG＞0的反应在2000K的AIMD里却能观察到呢，这有点超出我的知识面了。 ，2000K的AIMD模拟表明这根键总是第一个断开，但是柔性扫描扫出来该断键过程的ΔG＞0，凭我的知识有点难以理解原因。

xuyangsyo

2877321934 发表于 2025-6-27 16:12
懂了，谢谢老师，不过为什么ΔG＞0的反应在2000K的AIMD里却能观察到呢，这有点超出我的知识面了。，2000K ...

吉布斯自由能只是宏观上的统计值，对单个分子讨论吉布斯自由能没有意义，自由能判据确定反应方向是在宏观系统的基础上进行的；另外，理论上柔性扫描没法得到驻点，你是怎么算扫描过程的ΔG的？

2877321934

xuyangsyo 发表于 2025-6-27 17:27
吉布斯自由能只是宏观上的统计值，对单个分子讨论吉布斯自由能没有意义，自由能判据确定反应方向是在宏观 ...

抱歉是电子能量的变化趋势大于0，我这个说法确实很不严谨，想当然的认为吉布斯自由能和电子能量的变化趋势一致了。

wzkchem5

2877321934 发表于 2025-6-27 17:40
抱歉是电子能量的变化趋势大于0，我这个说法确实很不严谨，想当然的认为吉布斯自由能和电子能量的变化趋 ...

你可以这么理解：你用手把一块橡皮泥拉长，体系的能量是单调上升的，因为不管你拉得多长，都只可能感受到拉力而不会感受到推力。但是这不妨碍你能把橡皮泥拉断。

2877321934

wzkchem5 发表于 2025-6-27 17:46
你可以这么理解：你用手把一块橡皮泥拉长，体系的能量是单调上升的，因为不管你拉得多长，都只可能感受到 ...

懂了，谢谢老师。