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[分子对接] 关于AF3的一个有趣的发现

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楼主

发表于 Post on 2025-6-16 08:35:27 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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同志们，我现在有个有趣的发现，使用af3进行分子对接的结果页面底下有一行字，Non-commercial use only, subject to AlphaFold Server Output Terms of Use; no use in docking or screening tools.明明用来对接的结果非常好，为啥不能用于进行对接？

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发表于 Post on 2025-6-16 12:01:53 | 只看该作者 Only view this author

本帖最后由 student0618 于 2025-6-17 11:27 编辑

他指的是不可用AF3 output再作docking。
使用条款有举例如AutoDock的。

见https://alphafoldserver.com/terms

以前猜他加这么多限制大概以后想做收费的服务吧，尤其是不开放自订小分子，根本validate不到他有多准确。

以前有个产学合作的项目，也用不了他。

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敬仰一针见血的指责，厌倦别有用心的赞美。

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楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-16 17:16:35 | 只看该作者 Only view this author

student0618 发表于 2025-6-16 12:01
他指的是不可用AF3 output再作docking。
使用条款有举例如AutoDock的。

积分不到50看不到...，大佬能加个QQ或者微信吗？

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发表于 Post on 2025-6-17 10:31:21 | 只看该作者 Only view this author

本帖最后由 Serious 于 2025-6-17 10:32 编辑

student0618 发表于 2025-6-16 12:01
他指的是不可用AF3 output再作docking。
使用条款有举例如AutoDock的。

啊这，我都没注意

。。按照这样说，做研究发文章就不能用AF3结构做对接或者蛋白-配体复合体的模拟了..？

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发表于 Post on 2025-6-17 11:34:16 | 只看该作者 Only view this author

夜航星发表于 2025-6-16 17:16
积分不到50看不到...，大佬能加个QQ或者微信吗？

改10了, 加权限那句只是感歎愿意开源如BSD license的其他模型值得尊重。

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发表于 Post on 2025-6-17 11:45:26 | 只看该作者 Only view this author

Serious 发表于 2025-6-17 10:31
啊这，我都没注意。。按照这样说，做研究发文章就不能用AF3结构做对接或者蛋白-配体复合体的模拟了.. ...

个人是不敢的，也有提醒合作的实验组这点，(顺便推广推广开源的精神有多伟大？)。

真有需要就是比较开源的AF2结果跟它有多大分别，再用AF2结果来做。

敬仰一针见血的指责，厌倦别有用心的赞美。

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