高斯g_write报错

Danggui

情况：同一个高斯输入文件，在自己的电脑上面可以运行，但是在实验室电脑上面就会出现如下的 g_write报错，换成计算H2的报错提示也是下面的，同时不会生成chk文件，换了好几个新的输入文件也是立马弹出下面的报错
%nprocshared=32
Will use up to   32 processors via shared memory.
%mem=50GB
%chk=F:\1\Cu\optimiazation\Cu4.chk
g_write
问题：是硬盘内存满了吗，如下图的原因

我用的是window版本的高斯，请问如何删除rwf文件呢，直接打开Gaussian16W所在文件夹里面搜索rwf吗，请求大佬的帮助，十分感谢

sobereva

你先确保F:\1\Cu\optimiazation\目录确实存在。不存在的话显然不可能在里面产生新文件

Danggui

好滴，谢谢社长，刚刚又试了一下如下面所示：
%nprocshared=32
Will use up to   32 processors via shared memory.
%mem=50GB
%chk=F:\dtt\Cu4.chk
g_write

snljty2

Danggui 发表于 2025-6-19 14:41
好滴，谢谢社长，刚刚又试了一下如下面所示：
%nprocshared=32
Will use up to   32 processors via sha ...

先参考一下 http://bbs.keinsci.com/thread-13660-1-1.html。这里写NoEigenTest也无意义。

Danggui

snljty2 发表于 2025-6-19 15:31
先参考一下 http://bbs.keinsci.com/thread-13660-1-1.html。这里写NoEigenTest也无意义。

谢谢，刚刚看了您推荐的这篇帖子学习到了新的知识。但我之前是觉得我想跑重金属选择体系会出现问题所以我还再来回换基组之后一直报错一下午的时间后，在晚上重新算了之前学习的时候计算成功的H2也是出现了下面所示的加粗报错提示，想问一下这种情况该如何解决呢（这种情况会不会是软件的问题呢？）
%nprocshared=32
Will use up to   32 processors via shared memory.
%mem=50GB
%chk=F:\1\Cu\optimiazation\Cu4.chk
g_write

zjxitcc

键盘上同时按Win+R这两个按键，然后输入cmd三个字母，按确定，出现命令行对话框，依次输入以下三行命令
echo %TMP%
echo %TMPDIR%
echo %GAUSS_SCRDIR%
然后展示运行结果（不要凭记忆手敲，用复制贴贴或者截图展示）

Danggui

zjxitcc 发表于 2025-6-19 16:23
键盘上同时按Win+R这两个按键，然后输入cmd三个字母，按确定，出现命令行对话框，依次输入以下三行命令
ec ...

[img][/img]
试了，结果如下（我的等级好像不能再发照片了），请问这能看出什么吗，输入完指令后只剩黑色了，下面是粘贴的全部有文字显示的结果：
Microsoft Windows [版本 10.0.19045.5854]
(c) Microsoft Corporation。保留所有权利。

C:\Users\PC>echo %TMP%
C:\Users\PC\AppData\Local\Temp

C:\Users\PC>echo %TMPDIR%
%TMPDIR%

C:\Users\PC>echo %GAUSS_SCRDIR%
%GAUSS_SCRDIR%

C:\Users\PC>

Uus/pMeC6H4-/キ

Danggui 发表于 2025-6-19 19:25
[/img]
试了，结果如下（我的等级好像不能再发照片了），请问这能看出什么吗，输入完指令后只剩黑色了，下 ...

幻灯片里提到的%GAUSS_SCRDIR%环境变量明摆着没设置嘛，不过这也不奇怪，毕竟不是所有Gaussian安装教程都会提这点。
类似上面的操作，同时按win+R两个按键，输入g16w并按回车打开Windows版Gaussian的图形界面，再同时按ctrl+P两个按键打开Gaussian Preferences窗口，看到的Bin Path、Scratch Path、Output Path、Input Path四个选项又是什么内容？请逐个复制粘贴结果。

此外，如果方便的话可以把输入文件本身也作为帖子附件上传一下，有可能除了楼上已经提到的PBE0泛函的关键词写法外还有其他问题。

zjxitcc

Danggui 发表于 2025-6-19 19:25
[/img]
试了，结果如下（我的等级好像不能再发照片了），请问这能看出什么吗，输入完指令后只剩黑色了，下 ...

g_write是硬盘满了，或者是Gaussian临时文件所在的某个硬盘分区满了，与内存无关。上述3条命令是查看临时文件路径。你已经展示了运行结果，综合起来看，这说明你在Gaussian图形界面的Scratch Path没设置 或 没设置为真实存在且合理的路径（见8L的回答 如何打开Gaussian图形界面查看相关路径）。另外，如果你待会要更改Scratch Path，最好是指向一个比较空的硬盘，并且有写入权限的，最好是不要指向C盘的某个路径。

Uus/pMeC6H4-/キ

楼主给我私信了输入输出文件，从输出文件第一行Entering Link 1 = E:\software\gaussian\G16W\l1.exe PID=     12680.可以看到Gaussian的实际安装路径。此时应当检查E盘整体还有多少空余空间，安装路径E:\software\gaussian\G16W内是否有Scratch文件夹，该文件夹内是否有名叫"Gau-[一串数字].[后缀]"的文件；如有，请先确认当前电脑上没有跑其他的Gaussian任务，然后再删除这些文件。

编辑：至于计算本身，从输入文件看楼主应该是想优化一个Cu2+与EDTA的络合物。但初始结构里有俩碳原子不符合sp3杂化的正常键角，羧基的去质子化状态与净电荷不符，而且关键词也写得不好。从文献里找到[Cu(EDTA)]2-的合理初始结构，在PBE0-D3(BJ)/def2-SVP级别下结合隐式溶剂模型表现水环境优化的输入输出文件如下所示，注意带了D3色散校正。
cu_edta.tar.gz (3.9 MB, 下载次数 Times of downloads: 3)

2025-6-20 00:52 上传 Uploaded

点击下载
Click to download

实际上即使是几何优化，此处的def2-SVP基组也有提升空间，如能给N与O用带弥散函数但非内置的ma-def2-TZVP、其他用def2-TZVP会更加理想。

Danggui

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-6-19 20:31
楼主给我私信了输入输出文件，从输出文件第一行Entering Link 1 = E:\software\gaussian\G16W\l1.exe PID=  ...

一、不好意思昨天忘记把您提到的输入结果展示了（还是不能上传照片）
1.cmd结果展示，以下是CMD的全部展示了，后面还是空白的
Microsoft Windows [版本 10.0.19045.5854]
(c) Microsoft Corporation。保留所有权利。

C:\Users\PC>echo %software\gaussian\G16W%
%software\gaussian\G16W%

C:\Users\PC>echo %D:\gaussian 16W for scratch%
%D:\gaussian 16W for scratch%

C:\Users\PC>echo %E:\software\gaussian\G16W%
%E:\software\gaussian\G16W%

C:\Users\PC>echo %E:\software\gaussian\G16W%
%E:\software\gaussian\G16W%

C:\Users\PC>
2.Prefences:
ASCLL Editor:NOTEPAD.EXE
Bin Path:E:\software\gaussian\G16W
Scratch Path:E:\software\gaussian\G16W
Output Path:E:\software\gaussian\G16W
Input Path:E:\software\gaussian\G16W
3.E:\software\gaussian\G16W有Scratch文件夹，但是里面是空的
二、对于编辑：我是看了一位南航的老师关于定向去除Cu(ii)EDTA的论文，在网上搜索了Cu(II)EDTA的结构式直接建模的，其中应该还有两个Na但是由于没有想好怎么放还是直接不放，目前是想尝试跑一下他的论文但是目前一直不知道该如何编写，非常感谢博主大大的建议，我将马上尝试！
对于软件这块请问博主大大应该如何进行修改还是直接重新安装

Uus/pMeC6H4-/キ

Danggui 发表于 2025-6-20 13:36
一、不好意思昨天忘记把您提到的输入结果展示了（还是不能上传照片）
1.cmd结果展示，以下是CMD的全部展 ...

第1点的操作莫名其妙、没有意义，我不知道是上面哪句话被理解成这样了；在命令行(Command Prompt, cmd)里这样执行echo命令得到“后面还是空白”的结果毫不意外。
第2点的输出倒是符合我Gaussian安装于E盘、读写临时文件的Scratch Path也放在E盘的推断，但是最重要的“检查E盘整体还有多少空余空间”结果没见展示。正如9楼说的这帖一开始问题就出在硬盘满了，现在把检查范围确定在E盘，那为什么不检查呢？当然其他盘满了或许也可以清一清，但现在要跑Gaussian肯定得先从E盘开始腾空间嘛。除非E盘其他东西都完全不能动，这样也得先讲清楚为什么不能动、还有哪些盘有足够空间，再考虑改变量设置或者重装的事情

说到计算本身，“定向去除Cu(II)-EDTA”的描述不够清晰，需指明更多细节（比如是什么溶液环境、都有什么离子与试剂、去除方法是固体吸附/液相萃取/形成沉淀/化学反应还是别的什么过程）才能进一步讨论。一般这种多齿配体的金属螯合物结构适合从文献找而不是从网络数据库随便找，我之前发过一帖说这事。

Danggui

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-6-20 14:32
第1点的操作莫名其妙、没有意义，我不知道是上面哪句话被理解成这样了；在命令行(Command Prompt, cmd)里 ...

感谢老师给予的帮助，最近期末所以回复的比较慢，非常感谢您的帮助！
第一个是因为以为要像z老师说的也运行cmd来看看结果，出现的结果也是空白
第二个是E盘很空（1.52TB/3.63TB),scratch path路径里面的文件夹没有任何文件，服务器上面只有D盘满了其他空间都蛮多的。怕修改错是因为这个是之前大课题组的师兄安装的可能毕业的师兄在上面存了东西（也有其他人用过了），目前不知道怎么修改也不敢轻易动
第三个问题谢谢老师告诉我学习的方法，我现在就找文献看看，目前没有想好在什么环境和阶段，还处于一个尝试的过程

Uus/pMeC6H4-/キ

Danggui 发表于 2025-6-23 09:40
感谢老师给予的帮助，最近期末所以回复的比较慢，非常感谢您的帮助！
第一个是因为以为要像z老师说的也 ...

等下，既然说到D盘满了，11楼提到的D:\gaussian 16W for scratch这个路径从何而来，是否存在、是否有我10楼说的Gau-打头的文件？是不是我问的Preferences的Scratch Path实际上不在E盘而应该是这个，但11楼复制粘贴错了？又或者电脑上是否有多个不同版本的Windows版Gaussian共存？
如果Gaussian软件装在E:\software\gaussian\G16W这个目录且E盘还有足够空间，那可以考虑在这个目录下创建Scratch文件夹，并修改Scratch Path指向之，这样可以解决此帖最开始的问题。改完了记得做个记录或者和其他用同一台电脑跑Gaussian的人说一声。

入门计算化学推荐看社长的http://sobereva.com/355这篇，计算方面的理论和实操问题都可以看看社长的博文以及本论坛过往的大量讨论哦

Danggui

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-6-23 12:56
等下，既然说到D盘满了，11楼提到的D:\gaussian 16W for scratch这个路径从何而来，是否存在、是否有我10 ...

1.没有粘贴错误，刚刚检查了一下，D盘确实有Scratch文件，并且清完我自己的部分之后也能运行一段时间，应该是软件安装在了E盘但是把Scratch文件放在了D盘，请问老师Scratch文件里面的东西可以直接移走或者删掉吗，只保留in，chk和out文件行吗
2.我会根据老师改在其他盘的
好滴非常感谢老师提出的学习方法