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[Gaussian/gview] 求助过渡态能垒 使用溶剂化校正后自由能能垒为负值

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本帖最后由 小张ai学习 于 2025-6-19 19:27 编辑

各位老师们好。本人最近研究催化剂和溶剂模型对反应的影响。首先在气相下优化反应物、过渡态、产物,级别为b3lyp /6-31g(d,p),em=gd3bj,然后使用高精度计算单点能m062x/6-311+g(d,p),分别计算气相下,以及使用隐式溶剂SMD模型计算水相下的单点能,发现在气相下过渡态能垒正常为正,但是水相条件自由能能垒为负,并且单点能能垒也为负,想问一下各位老师这种情况合理吗?


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发表于 Post on 2025-6-19 22:31:04 | 只看该作者 Only view this author
如果反应中体系偶极矩有显著变化,可能需要在溶剂模型下优化过渡态。例如:NH3 + CH3Cl = [CH3NH3]Cl,不加溶剂模型可能找不到过渡态。

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现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-19 23:07:10 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2025-6-19 22:31
如果反应中体系偶极矩有显著变化,可能需要在溶剂模型下优化过渡态。例如:NH3 + CH3Cl = [CH3NH3]Cl,不加 ...

老师您好,我的体系是石墨烯表面,应该对于偶极矩不太敏感吧

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发表于 Post on 2025-6-22 06:59:50 | 只看该作者 Only view this author
小张ai学习 发表于 2025-6-19 23:07
老师您好,我的体系是石墨烯表面,应该对于偶极矩不太敏感吧

你当前观察到的现象已经暗示溶剂效应可能对过渡态结构有不可忽视的影响。尝试在溶剂模型下重新优化过渡态和极小点
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-22 20:14:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-6-22 06:59
你当前观察到的现象已经暗示溶剂效应可能对过渡态结构有不可忽视的影响。尝试在溶剂模型下重新优化过渡态 ...

谢谢sob老师,我用溶剂化重新优化后确实发现有能垒了,但是b3lyp /6-31g(d,p) 下算了自由能能垒,气相是6kcal/mol,溶剂化后是1kcal/mol,但是使用m062x/6-311+g(d,p)校正单点能之后,发现二者都是5kcal/mol左右了,是不是还要以校正之后的为准啊,为什么会差距这么多呢?

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发表于 Post on 2025-6-23 04:59:00 | 只看该作者 Only view this author
没有“校正单点能”这种说法。那叫计算高精度单点能
b3lyp/6-31g(d,p) 这么烂的级别算自由能垒毫无意义,根本不需要把数据摆出来
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