[分子对接] 求助各位老师，如何做配体与蛋白质二聚体的分子对接

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发表于 Post on 2025-7-14 18:21:21 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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请教各位老师：针对一个对称长链配体（两端含高亲和力基团，可以牢固结合在在蛋白质的活性腔内）插入蛋白二聚体内部的模拟问题，常规分子对接因局限于单一连续活性口袋，难以实现配体同时桥接两个单体的结合模式。现有三个思路请指导：1. 诱导契合对接（IFD）能否实现跨二聚体结合？2. 若先将一端对接至单体，另一端施加位置限制势进行动力学模拟是否可行？3. 此类复杂结合是否必须依赖X射线晶体学解析？恳请建议适用方法或推荐其他计算策略。

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