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[新手求助] 求助使用Gaussian寻找胺吸收CO2的中间体与过渡态

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求助图中反应路径内2-RC-2的自由能是怎么算的?为什么加了一个水分子,却只比2-RC-1低10.79Kcal/mol?麻烦老师们解答。

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发表于 Post on 2025-7-20 09:03:15 | 只看该作者 Only view this author
你为什么觉得低的不止这个数
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-20 09:39:21 | 只看该作者 Only view this author
Wang老师,我做的体系跟这个差不多,也是计算水分子充当质子载体,水分子计算本身就有-70多a.u.,与氨基甲酸酯分子加和后仍然比氨基甲酸酯分子低70多a.u.?这个是怎么回事呢?谢谢老师。

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发表于 Post on 2025-7-20 11:33:19 | 只看该作者 Only view this author
15266729604 发表于 2025-7-20 09:39
Wang老师,我做的体系跟这个差不多,也是计算水分子充当质子载体,水分子计算本身就有-70多a.u.,与氨基甲 ...

高中物化就讲了啊,要减去你加入水分子的能量。你给的2-RC2,就是(中间体的能量+水的能量)-(2-TS1的能量+水的能量) . 只不过是习惯上在机理图上只给参与反应的两步画上反应物或产物。

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5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-20 14:07:52 | 只看该作者 Only view this author
玉米猫 发表于 2025-7-20 11:33
高中物化就讲了啊,要减去你加入水分子的能量。你给的2-RC2,就是(中间体的能量+水的能量)-(2-TS1的能量+ ...

好的 谢谢 我试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-20 22:53:34 | 只看该作者 Only view this author
玉米猫 发表于 2025-7-20 11:33
高中物化就讲了啊,要减去你加入水分子的能量。你给的2-RC2,就是(中间体的能量+水的能量)-(2-TS1的能量+ ...

您好,您所说的“中间体的能量+水的能量”是指图中谁的能量?我其实就是知道2-RC2的能量是怎么计算的?还望解答,谢谢。

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