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本帖最后由 KazusaT 于 2025-7-26 14:47 编辑
今天在使用AMBER19SB力场配套OPC水模型模拟小肽折叠-聚集过程时发现运算速度比之前慢很多,查看发现update被放到cpu了,于是添加-update gpu结果报错:
Inconsistency in user input:
Update task can not run on the GPU, because the following condition(s) were
not satisfied:
Virtual sites are not supported.
使用的是刚编译好的Windows版GROMACS 2025.2这里的GROMACS 2025.2 Windows预编译版本,随后在Ubuntu下我自己编译的GROMACS 2025.2下则可以正常-update gpu,速度没有异常,请问有人遇到相似的问题吗?这是预编译的普遍问题还是该预编译版本的问题?
【更新】Linux版本也不可以,是我测试时用了错误的文件误以为可以,应该是目前GROMACS还不支持使用OPC水模型时GPU加速PP update
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