MS实现石墨烯的矩形胞到菱形胞的转变

mylifecg · 发表于 Post on 2017-4-5 20:19:15

石墨烯是六角原胞，原胞内含有两个c原子，ms里通过热defined lattice可是实现2原子菱形胞到4原子矩形原胞的转变，那么我的问题是，如何实现从4原子的矩形原胞再转变成2原子的菱形原胞？各位大神可否指点迷津？

卡开发发 · 发表于 Post on 2017-4-5 20:25:26

线性代数问题。原来菱形变成矩形时redefined lattice中的3x3数看成矩阵，然后求这个矩阵的逆矩阵，等逆变换的时候把逆矩阵填上就是了。

找对称性有时候也有用。

mylifecg · 发表于 Post on 2017-4-5 21:49:11

卡开发发发表于 2017-4-5 20:25
线性代数问题。原来菱形变成矩形时redefined lattice中的3x3数看成矩阵，然后求这个矩阵的逆矩阵，等逆变换 ...

你好，你说的办法我已经试过了，会出现分数或者小数的矩阵元，在MS里redefined lattice是不能用分数或者小数的。

卡开发发 · 发表于 Post on 2017-4-6 03:24:35

本帖最后由卡开发发于 2017-4-6 04:01 编辑

mylifecg 发表于 2017-4-5 21:49
你好，你说的办法我已经试过了，会出现分数或者小数的矩阵元，在MS里redefined lattice是不能用分数或者 ...

如果小数是有理数，可以乘以公因子放大到整数。

其实还可以build->lattice parameter改变晶格参数，去掉勾选keep fractional coordinates fixed就行了，ms有这个选项。

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[CASTEP/Dmol3/MS] MS实现石墨烯的矩形胞到菱形胞的转变