可生成任意聚合度线形聚合物结构、拓扑以及电荷的在线程序

Xexhauster

求助 status显示success后，下载的all_results.zip里是空的，这是为什么
gAAAAABo53PsIAsBSiZgcwmhXKarzCLdX5Y288tU3hV4VL4lqQ5qQ1ax_9_k4mFZDN8x4aGk5ZYf5YpVmnsOIbwBVEyic0hpe7Uf6DorAloKo_q1E7cXRUBzTc8s-eVlEIz30AH-GTmi1J3AWDb7y7PFsQ1gA8vWbUboYU2sVu0X9kSUDYJY29LDhAXWBTg8NnbInS1i91IupHB1BSjvW7NRmGUzHYMM_Qp8eJhwgYQyQCjZNnQDDfTDRjW7M4yZIk7l9Hq5oFEQ3cHEUcabZ93MinP3nOwiqwZHLL0wtVRza8mls7fr7C3GYB1HQNvzJHcE9jTSb81cGQBP2f1LerMuX0NIXcNulJVx1x4wnT42vf0z0R_URe3B77wCsIzg5QULGCna6BZvV-x4dS3ITOCO80D-irho5tGXCjPuE_i6M72WkVKOQD8=

zhouhaifan

Xexhauster 发表于 2025-10-9 17:20
求助 status显示success后，下载的all_results.zip里是空的，这是为什么
gAAAAABo53PsIAsBSiZgcwmhXKarzCL ...

我也是今天下午提交的，状态显示成功了，但是下载出来显示是一个空的

牧生

gAAAAABo9YWvPKeeu0Woyjb1k5FG9gSi9scycKWyiETrnhqI_D5CUeEZ7h49TszCUccE1tmLRQn5j89Y8tyYpPIbVO6IWRjmz8J0KUvalfOBbFvlFJv4LYdjFl9jDubYh0RqBm8MGKZbZ7GoW1RpkBDT1-HE6J49H5lupV0mL9xUYplSSNNyYLizJ-7iCAQHEPeFNsX378V*So9rm8K3XC6AyZyQL9OWlYm_z6j1_arJcz13-oBgKAKXPRBPT1CPZjq_lFzAYAC-oGBD4olrSbOcFhyRhvKBi_ZOKbjVlzLUw7fSlzG6wZENRJEeJr5Z0C8yfTCpMtKHBIpKWuLCELOs6GLZDoycAaF1k_KGUM8_3A7H9IhP-uwPEpKnr-fL6118suHWf0itGCmUpPAMrvCPuCMmevduo8-VcKpeaJB_An2eqv7AvNiJgkYSMRlzh0PujbSCv8Ue


请帮忙看一下，近日发现生成的聚合物的总电荷不太对劲。。

如上是我用9个不带电的丙烯酰胺和带1个带-1电荷的丙烯酸得到的无规聚合物，但是得到的总电荷为 +7.460962

白也

今天简单使用了一下，挺不错，有几个问题和建议：
1. 今天试的两个例子均出现了原子净电荷不为0的问题，1400左右原子大概会有5个电荷的偏差；
2. 可以添加个选项，不进行原子电荷计算，只输出结构（考虑到有些用户可能只需要结构），这样会降低不必要的机时消耗；
3. 考虑到聚合物这么大的体系，体系优化也没必要使用6-311G**这么大的基组，一般的6-31g*其实就可以，orca中的B97-3c方法是一个很好的选择，或者是xtb的GFN0-xTB方法。
最后，感谢大佬耗费精力做的网页

yuzc

王博，太好用了。诸如CMC-阴离子，聚离子液体等结构的无规共聚也能完全重现出所需要的partial charge。对称共轭位置上也是相等的电荷和同样的力场类型。
此外我完全同意楼上的一个建议，就是给出选项不计算电荷或给出快速的MMFF94电荷，同时保留RESP电荷计算时的大基组，高标准高精度。

archer

进入网页，为什么点击不了generate polymer

bubaixiji

很好用，不过电荷有一点问题，我主要是用来生成聚合物结构的。     
前几天还能用，但是今天（2026年3月11日）发现进不去了，不知道是因为更新还是什么

bubaixiji

bubaixiji 发表于 2026-3-11 13:39
很好用，不过电荷有一点问题，我主要是用来生成聚合物结构的。     
前几天还能用，但是今天（2026年3月11 ...

晚上看，恢复了，应当是网页维护

K1ro

楼主，您好，想请教以下任务是由于网络连接所产生的失败吗？尝试聚合共聚维酮PVP VA64的结构，两个SMILES式子都使用了楼主所述的结构检查网站https://cleanenergymaterials.cn/autocompute/smilesdrawer，没有发现明显问题。
任务id:gAAAAABptUvKjSe1qEA0azobv3_ikcpJTzYZUrJfSOosSzsdQopsGwlAiKrdQ32EL5AjK6SwZvLstIAQNtgfhQFdBOmE2ElTGhZTGRQsfRXtveorBYFbscXBgI6QZpvkRjKzoNCG4xE1WcwlI2fgZtoJomell8vFnjju7SarX-GOY-VvyMVPpkNHu6Vhos07mqOi_3NKN3w2vuc7DIAIqanN5hqceZqgcfOgN4yTXIEtrX_T5TrjNS8xMtvDs8pEGN9cxzsaMpAukNIaPweve6gqwHK6UrEPzDA8AF-q9l1xEfkUOwQSuiLUXafPMjk6vzOcdm9BhpiJP_u3pQizUptyTb4g7zQHZW5TxDxJIu4Dv2DorCYR0CRaJvqCPyDXREFH6NFeydtzjk-GBie1qD5TIApkkH3aC5Ou3LxhC642s-5Eptx_xCs3BheyGCMxZL6Q9Oce8Wed

线性聚合
聚合方法：Random Copolymer
单体：
NVP SMILES：O=C1N(CCC1)C([星号])C[星号]；重复数目6
VAc SMIKLES：CC(OC([星号])C[星号])=O；重复数目5

Checker返回的报错提示是：Failed to run notebook 2_Polymer_chg_and_Polymer_creation_Linear_polymer.ipynb: Connection to 10.158.157.58 closed.

如您能抽空回答，十分感谢！