求助VOTCA在进行电子耦合计算时提示未导入

like_liu

各位老师大家好，
最近我在进行小分子材料迁移率的计算，对于薄膜形态的小分子，目前有一些文献使用gromacs结合VOTCA软件进行计算。
在使用VOTCA软件过程中，遇到如下的问题，恳请各位老师赐教：


（1）在进行耦合计算前，需要准备一个使用段对和激子标签的写入文件，如20:n2s1，同时下一步会用到这个写入文件的mps文件：20:n2s1.mps，这个mps文件如何生成呢？貌似与教程中前面步骤用到的n、h、e的mps文件不同，目前我尚未找到如何产生20:n2s1.mps的文件方式。


（2）在使用官网教程使用 GROMACS 和 VOTCA-XTP 的 QMMM 工作流程 — VOTCA 2025-dev 文档中的耦合分析时，提示耦合未导入，见图2，不知是何原因，如何导入这个耦合。

所有提到的文件都放在附件了，希望可以有使用过VOTCA软件进行计算的老师来指导我，万分感谢！祝各位老师科研顺利。

xgnihao

mps文件是原子电荷文件，用orca计算获得的log文件可以生成：xtp_tools -e log2mps -o log2mps.xml

xgnihao

我猜一个可能的原因是： 耦合计算结果是在 qmmm_jobs.xml文件中保存着是吗？ 你用ianalyze 功能分析的时候，state.hdf5文件里没有耦合计算结果的相关信息。要先把耦合计算结果read到state.hdf5文件中： 具体命令和你生成qmmm_jobs.xml文件时类似，但把“write”改成“read”