计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: mayang
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 关于较大分子脱CO进行NEVPT2计算时活性空间选择和单点能计算准确性

[复制链接 Copy URL]

12

帖子

0

威望

35

eV
积分
47

Level 2 能力者

16#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-17 19:50:30 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mayang 于 2025-9-17 19:53 编辑
zjxitcc 发表于 2025-9-11 17:02
如果我没理解错,你这里能垒是指TS11与W10的相对能量?能展示一下TS11和W10的UCCSD(T)/cc-pVTZ具体能量数值 ...
ccsd(t)
TS11:-383.4820859 Hartree
W10:-383.4953641 Hartree

nevpt2(11e,11o):
TS11:-383.50238 Hartree
W10:-383.50602 Hartree

12

帖子

0

威望

35

eV
积分
47

Level 2 能力者

17#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-17 19:55:34 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2025-9-11 17:02
如果我没理解错,你这里能垒是指TS11与W10的相对能量?能展示一下TS11和W10的UCCSD(T)/cc-pVTZ具体能量数值 ...

ccsd(t):
TS11 -383.4820859;w10 -383.4953641
nevpt2(11e,11o):
TS11:-383.5023788
w10:-383.50601683

4279

帖子

4

威望

9477

eV
积分
13836

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

18#
发表于 Post on 2025-10-5 11:29:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2025-10-5 11:35 编辑

这个问题比较复杂。可以分为两部分来理解

(1)UCCSD(T)计算
W10这个体系有两个UHF解,在cc-pVTZ基组下电子能量分别为 (单位: a.u.)
solution 1 solution 2
UHF -381.911153 -381.922008
UCCSD(T) -383.495364 -383.490805

第一个UHF解是不稳定的,第二个是稳定的。你用了前者进行UCCSD(T)计算,这通常是不合理的。有一个经验规律是,不稳定的UHF解通常会导致更大的相关能,所以尽管你的UHF能量偏高,但你的UCCSD(T)能量却偏低(这不是什么好事)。可能你是用Gaussian/ORCA“写一行关键词,提交1个任务获得结果”这种黑箱方式做的计算,以为这样就可以了,没有检验UHF波函数稳定性。对于电子结构较为复杂的体系,即使是单参考计算也要加倍小心,无论使用哪个传统量化软件都要仔细检查计算过程和计算结果。建议先做UHF计算,检验UHF波函数稳定性,确保波函数稳定,然后读取UHF波函数进行UCCSD(T)计算,分成两三步。

而你给出的TS11分子只有一个UHF稳定解,UHF能量是-381.910078 a.u., UCCSD(T)能量是-383.482087 a.u., 所以这一基元步骤的UCCSD(T)电子能垒是5.47 kcal/mol。这一步如果弄错了,后面对比NEVPT2能垒就容易困惑
最后算出的能垒为2.3kcal/mol(NEVPT2/cc-PVTZ,没有加零点能校正),比CCSD(T)/cc-PVTZ低了6kcal/mol

(2)NEVPT2计算
这一基元步骤所需的最小活性空间为CAS(3,3),活性轨道包含目标C-C键成键轨道、反键轨道,以及体系自身二重态对应的1个单占据轨道;对应的活性电子也是3个。

上图是W10的3个重要GVB轨道,可以用GaussView/Multiwfn打开文件W10_cc-pVTZ_uhf_uno_asrot2gvb22_s.fch进行可视化。在W10分子中目标C-C键还未断裂,成键轨道占据数为1.99,非常接近2.0,因此本段所说的“重要”不是根据活性轨道占据数来判断的,而是根据基元反应机理判断的。目标C-C键轨道不在32号轨道附近,需要用permute_orb()函数将其调换至31号、33号轨道位置。

理论上讲CAS(3,3)就足够了,可能你会疑惑NEVPT2(3,3)是否足够准确,这的确需要测试。我们可以使用更高阶的多参考方法例如FIC-MRCISD+Q或FIC-NEVPT4(SD),这两个在ORCA里都有,在活性空间合理的情况下往往可以获得靠谱的结果。若活性空间增大,由于基组cc-pVTZ下空轨道数目较多,FIC-NEVPT4(SD)大概率算不动。这是我算的结果

可以看到,基于CASSCF(3,3)的FIC-NEVPT2和FIC-NEVPT4(SD)能垒与UCCSD(T)能垒很接近。就算FIC-NEVPT2结果是凑巧,还有FIC-NEVPT4(SD)可以说明问题。如果一定要追求更大活性空间,需要小心地增加的活性轨道和活性电子。使用MOKITautomr对W10和TS11分别进行自动CASSCF/cc-pVTZ计算,自动确定的活性空间分别是(7,7)和(9,9),显然我们需要增大/减小活性空间使二者一致。

注意,无论看xxx_gvbN_s.fch文件(在这里N=21或22)还是xxx_CASSCF_NO.fch文件,都可以看出活性轨道主要成份,前者是后者的初始轨道。但如果要调换轨道实现活性空间的一致,则需要调换第一个文件,这是因为GVB pair轨道是局域在每一根化学键上的,化学意义十分清晰,而CASSCF自然轨道是离域在整个体系中的,往往作为结果查看,而不作为可调换的过程。GVB是automr做自动CASSCF计算默认的一个中间步骤,它也很重要,不能忽略它直接去看CASSCF自然轨道。待我们看完这两个文件中的轨道
W10_cc-pVTZ_uhf_uno_asrot2gvb22_s.fch
TS11_cc-pVTZ_uhf_uno_asrot2gvb21_s.fch
可以发现乙烯基取代五元环上3根C-C pi键是比较重要的轨道,占据数偏离2.0/0.0最多,同时它们也跟自由基轨道可能共轭

所以优先将这3对轨道加入活性空间。注意每根化学键对应一对轨道(成键和反键轨道)、2个电子,因此在CAS(3,3)基础上扩增为CAS(9,9),电子能垒变为4.38 kcal/mol(见上面表格数据),还算合理。若还想进一步扩大活性空间,应当优先考虑C-O pi键(因为它在GVB轨道里是偏离2.0/0.0次多的),从而可以构造CAS(11,11)。但这里有个额外的问题,如果进行CASSCF(11,11)轨道优化,W10体系计算会很顺利(能量丝滑下降,下降幅度小,很快收敛),但对TS11会发现CASSCF轨道变化较大,能量下降较多,这是因为在W10的GVB和CASSCF计算中C-O上始终只有一根C-O pi键和一根C-O sigma键,O的其他价电子是俩 孤电子对,在TS11的GVB计算中也是这样;但在TS11的CASSCF计算中有两根C-O pi键、一根C-O sigma键、一对O孤电子,意思就是有一对O孤电子转变成了O->C 配位pi键,成键方式发生较大变化,需要进一步扩大活性空间,将O的孤电子对、C-O sigma等加入活性空间,问题趋于复杂。有一个折中的奇技淫巧是,既然轨道比较合理,我们可以不做轨道优化,直接进行CASCI(11,11)-NEVPT2计算,把O的俩 孤电子对留在双占据空间里,不管它们怎么变化,这就是上述表格中FIC-NEVPT2(11,11) CIonly的来历,能垒为5.56 kcal/mol,也比较合理。

总结:该有机反应在单参考和多参考计算均合理的前提下,二者能垒非常接近(有1.0 kcal/mol左右的区别是正常的,但不会有6 kcal/mol的区别)。
PS1: NEVPT2方法有两个变种SC-NEVPT2和FIC-NEVPT2,后者稍微准确一点点,本回答用的也是FIC-NEVPT2方法。ORCA支持两种,PySCF目前仅支持SC-NEVPT2。
PS2: 如果使用MOKIT以及本文技巧发表文章,请记得引用MOKIT程序,点击此处可以查看引用MOKIT的53篇已发表文献。

计算涉及的输入文件和脚本见附件(没有提供GVB和CASSCF的fch文件以及输出文件,那些文件也比较大,不适合上传论坛。请阅读后自行练习计算,才能较好地理解)
C8H7O_cc-pVTZ_input.7z (4.52 MB, 下载次数 Times of downloads: 2)

评分 Rate

参与人数
Participants 6
eV +28 收起 理由
Reason
wang7344412 + 5 GJ!
反氯化苯 + 5
Melvin + 5 赞!
hebrewsnabla + 3 精品内容
北大-陶豫 + 5 精品内容
Uus/pMeC6H4-/キ + 5 好物!

查看全部评分 View all ratings

自动做多参考态计算的程序MOKIT

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-25 18:28 , Processed in 0.226056 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list