计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 487|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 关于DOS绘制时,选择片段后,TDOS值很高

[复制链接 Copy URL]

25

帖子

0

威望

147

eV
积分
172

Level 3 能力者

我是做团簇吸附的。基底原子个数大概100个左右,按照详谈使用CP2K产生给Multiwfn用的molden格式的波函数文件 - 波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn) - 计算化学公社生成了molden文件,后按照使用Multiwfn绘制态密度(DOS)图考察电子结构 - 波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn) - 计算化学公社这个,使用molden绘制DOS,片段1和2为团簇中的Al与O,片段3为挨着团簇的基底的第一层圆形区域(红圈)。绘制完成后为什么TDOS线那么高,这样导致其他线不凸显,怎么控制TDOS线呢?   附件为选择片段的命令。

202508251001003387..png (114.68 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

模型

模型

202508251000322037..png (33.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

DOS

DOS

选择片段.txt

203 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

1155

帖子

0

威望

4423

eV
积分
5578

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2025-8-25 10:30:53 | 只看该作者 Only view this author
这属于基础概念不明
TDOS 是 Total Density of States,即体系总体的 DOS,包含了体系里所有原子轨道的态密度,当然是最大的,当然会比你只取某一个片段绘制的 PDOS 大很多。

如果你要将 PDOS 的峰显示更清晰,可以将 TDOS 和 PDOS 分开绘图,横坐标相同,用上下两个图层来对比峰的位置。

25

帖子

0

威望

147

eV
积分
172

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-25 10:51:12 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2025-8-25 10:30
这属于基础概念不明
TDOS 是 Total Density of States,即体系总体的 DOS,包含了体系里所有原子轨道的态 ...

谢谢你的回复,我知道TDOS是体系总体的 DOS。我想知道是否可以使用Multiwfn使得TDOS计算的时候,也只计算自己选择片段的总DOS

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125122

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2025-8-25 11:16:52 | 只看该作者 Only view this author
阿宇没有雨 发表于 2025-8-25 10:51
谢谢你的回复,我知道TDOS是体系总体的 DOS。我想知道是否可以使用Multiwfn使得TDOS计算的时候,也只计算 ...

这不就是片段的PDOS,当然能绘制,下文说了
使用Multiwfn绘制态密度(DOS)图考察电子结构
http://sobereva.com/482http://bbs.keinsci.com/thread-13242-1-1.html

TDOS必定等于体系中所有原子的PDOS的总和,当前TDOS曲线高度和所有片段PDOS曲线高度之和相差悬殊显然说明还有大量其它部分没定义成片段。不想显示TDOS就让Multiwfn关闭显示就完了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

25

帖子

0

威望

147

eV
积分
172

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-25 15:28:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-8-25 11:16
这不就是片段的PDOS,当然能绘制,下文说了
使用Multiwfn绘制态密度(DOS)图考察电子结构
http://sobere ...

好的,感谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-17 21:02 , Processed in 0.247370 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list