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[CP2K] 密度差局部积分曲线绘制疑问

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本帖最后由 古与春分 于 2025-9-1 14:48 编辑

老师,我用cp2k在revPBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH做能量计算得到四个cube文件,按照博文http://sobereva.com/638绘制密度差局部积分曲线,计算公式是ρ=ρ_total(r)-ρ_(sur+water)(r)-ρ_(slab+water)+ρ_(water)。然后发现绘制出的密度差局部积分曲线在slab区域有波动,请问老师这个合理吗?相关inp和pdb文件已上传,cube文件太大没有上传。

Water.png (39.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

Water.png

Total.png (43.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

Total.png

Sur water.png (37.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

Sur water.png

Slab water.png (39.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

Slab water.png

local integral curve.png (35.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

local integral curve.png

slab water.inp

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slab water.pdb

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sur water.inp

23.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

sur water.pdb

36.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

total.inp

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total.pdb

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water.inp

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water.pdb

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发表于 Post on 2025-9-1 11:52:32 | 只看该作者 Only view this author
重新编辑帖子,把内容整理好
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-1 14:48:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-1 11:52
重新编辑帖子,把内容整理好

老师,已经重新编辑

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发表于 Post on 2025-9-2 09:37:24 | 只看该作者 Only view this author
我完全不清楚你算的到底是什么密度差,算这种密度差要做什么
密度差求完后先在Multiwfn里观看密度差的等值面图,确保合理、有意义,之后再说z方向积分的事
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-2 10:51:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-2 09:37
我完全不清楚你算的到底是什么密度差,算这种密度差要做什么
密度差求完后先在Multiwfn里观看密度差的等值 ...

老师,是密度差局部积分曲线,考察固液界面吸附导致的电子转移情况。等值面图是这样的,cubiso是0.004。

202509021050338284..png (108.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

EDD等值面图

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发表于 Post on 2025-9-2 10:55:35 | 只看该作者 Only view this author
古与春分 发表于 2025-9-2 10:51
老师,是密度差局部积分曲线,考察固液界面吸附导致的电子转移情况。等值面图是这样的,cubiso是0.004。

既然等值面没问题,根据局部积分曲线的定义,结合等值面图该怎么解释曲线怎么解释。取消显示分子结构,减小等值面数值,更有助于通过观看等值面理解微小的波动的来由。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-2 11:08:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-2 10:55
既然等值面没问题,根据局部积分曲线的定义,结合等值面图该怎么解释曲线怎么解释。取消显示分子结构,减 ...

好的老师,我再研究研究

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