计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7785|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 请问各位,我这样做是否合理?

[复制链接 Copy URL]

593

帖子

12

威望

4720

eV
积分
5553

Level 6 (一方通行)

密度泛函·小卒

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
现在我们面对的是一个这样的体系。两个负2价的酞菁环,夹着一个正3价的Tb原子。
我想考察配位之后,两个酞菁环的静电势场是啥样。
我打算做法如下:
首先,优化整个配合物分子,拿到它的波函数文件。这个分子必然是开壳层分子,所以我全部采用开壳层的UDFT方法来计算。
第二步,将这个分子视为两部分,分别命名为FragmentPc(两个酞菁环)和FragmentTb(就是Tb这一个原子)
第三步,衡量每一个占据轨道的分布,也就是每一个占据轨道分别在FragmentPc和FragmentTb上有多少布居百分比。
第四步,如果某一个占据轨道在FragmentPc上的布居为n(必然的是 0 < n < 1),那么,这个分子轨道的占据数我就直接从1改为n。
第五步,删除FragmentTb所属的全部基函数。
第六步,在改了轨道占据数,也改了基函之后,重新得到新的波函数文件。然后用这个文件去做静电势计算。
请问这样做是否可行?
一出生响亮登场,十几岁快乐成长,
二十岁天天向上,三十岁基本定向,
四十岁拼命打创,五十岁回首一望,
六十岁告老还乡,七十岁搓搓麻将,
八十岁躺在床上,九十岁挂在墙上,
人生一世,匆匆忙忙,生得嘹亮,走得凄凉!
生活就像五味瓶,酸甜苦辣难消停!
该吃吃,该喝喝,遇事别去心里搁,
想哭哭,想笑笑,烦恼就往云外抛,
记住甜,忘掉苦,亲人朋友好相处,
心情好,最重要,自我麻痹乐逍遥!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2017-4-12 11:11:04 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn里直接删除Tb的高斯函数就行了(主功能-4),没必要再调节占据数,否则最终效果就double-counting了。
另外,之后在Multiwfn里计算静电势之前,注意还得把Tb的原子核对静电势的贡献扣除。需要用自定义函数39,并在菜单里设定扣除哪个原子核的贡献,手册4.1.2的例子用到了这一点可参考。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

593

帖子

12

威望

4720

eV
积分
5553

Level 6 (一方通行)

密度泛函·小卒

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-4-12 11:37:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-4-12 11:11
Multiwfn里直接删除Tb的高斯函数就行了(主功能-4),没必要再调节占据数,否则最终效果就double-counting ...

非常感谢!原来sob君已经考虑了占据数问题了!再次感谢!
一出生响亮登场,十几岁快乐成长,
二十岁天天向上,三十岁基本定向,
四十岁拼命打创,五十岁回首一望,
六十岁告老还乡,七十岁搓搓麻将,
八十岁躺在床上,九十岁挂在墙上,
人生一世,匆匆忙忙,生得嘹亮,走得凄凉!
生活就像五味瓶,酸甜苦辣难消停!
该吃吃,该喝喝,遇事别去心里搁,
想哭哭,想笑笑,烦恼就往云外抛,
记住甜,忘掉苦,亲人朋友好相处,
心情好,最重要,自我麻痹乐逍遥!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2017-4-12 11:46:48 | 只看该作者 Only view this author
yjcmwgk 发表于 2017-4-12 11:37
非常感谢!原来sob君已经考虑了占据数问题了!再次感谢!


其实不是明确地去考虑了这个。
删除高斯函数就像切蛋糕,切掉1/4,剩下的自然而然就是3/4了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 04:10 , Processed in 0.154590 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list