openmpi和ORCA6.1.0安装时环境变量配置问题（orca报错）-经验交流

saaamon

最近在新购买的服务器(双路AMD7R32，96核心，512内存)上安装openmpi和ORCA6.1.0时遇到的一些问题，并尝试找到了解决办法（纯瞎摸索，不知其因，原因看社长回复，怪自己太马虎），跟大家分享经验：

1.openmpi 4.1.8和orca6.1.0按照sob提供的教程（量子化学程序ORCA的安装方法 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元）可以顺利安装，

但是在提交测试作业时出现报错，内容如下：

[server@localhosttest1]$ orca t.inp>t.out

/home/app/orca610/bin/orca_startup_mpi:error while loading shared libraries: libmpi.so.40: cannot open shared objectfile: No such file or directory

/home/app/orca610/bin/orca_startup_mpi:error while loading shared libraries: libmpi.so.40: cannot open shared objectfile: No such file or directory

/home/app/orca610/bin/orca_startup_mpi:error while loading shared libraries: libmpi.so.40: cannot open shared objectfile: No such file or directory

......

--------------------------------------------------------------------------

Primary job terminatednormally, but 1 process returned

a non-zero exitcode. Per user-direction, the job has been aborted.

[size=13.3333px]--------------------------------------------------------------------------

[size=13.3333px]/home/app/orca610/bin/orca_startup_mpi: error while loading shared libraries: libmpi.so.40: cannot open shared object file: No such file or directory

[size=13.3333px][file orca_tools/qcmsg.cpp, line 394]:

.... aborting the run

查了很多关于“Primary job terminated normally, but 1 process returned a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted.”帖子，

起初以为是mpi版本的问题，所以将4.1.8版本的mpi换成4.1.6，但是在提交测试作业依然出现同样的报错；另外也有说是任务内存设置过大的问题，尝试将内存和核数降低（%maxcore 1000 %pal nprocs  4 end）也无法解决问题；

束手无策的情况下将整条信息复制到google中搜索解决办法，AI倒是提供了一个解决办法，添加环境变量：

export LD_LIBRARY_PATH="/path/to/mpi/lib:$LD_LIBRARY_PATH"

于是我尝试在.bashrc中#openmpi相关的环境变量中添加如下两行环境变量：

复制原有的两行环境变量

export PATH=/home/app/openmpi416/bin:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=/home/app/openmpi416/bin:$LD_LIBRARY_PATH

并将其中的bin文件夹改成lib

export PATH=/home/app/openmpi416/lib:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=/home/app/openmpi416/lib:$LD_LIBRARY_PATH

最终的#openmpi环境变量如下：

#openmpi

export PATH=/home/app/openmpi416/lib:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=/home/app/openmpi416/lib:$LD_LIBRARY_PATH

export PATH=/home/app/openmpi416/bin:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=/home/app/openmpi416/bin:$LD_LIBRARY_PATH

export OMPI_ALLOW_RUN_AS_ROOT=1

export OMPI_ALLOW_RUN_AS_ROOT_CONFIRM=1

orca相关的环境变量未改动：

#orca

export PATH=$PATH:/home/app/orca610/bin

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/app/orca610/bin

alias orca='/home/app/orca610/bin/orca'

希望对遇到同样的问题的同学有所帮助！

sobereva

量子化学程序ORCA的安装方法
http://sobereva.com/451（http://bbs.keinsci.com/thread-11697-1-1.html）


我的博文里原本写的就是lib

export PATH=$PATH:/sob/openmpi416/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/sob/openmpi416/lib

PATH和LD_LIBRARY_PATH环境变量的用处完全不一样，前者定义可执行文件的搜索路径，后者定义动态库文件的搜索路径
你文中的下面两行是完全多余的
export PATH=/home/app/openmpi416/lib:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/app/openmpi416/bin:$LD_LIBRARY_PATH

saaamon

好的，感谢社长，还是自己太马虎了。

wangzh

sobereva 发表于 2025-9-28 00:47
量子化学程序ORCA的安装方法
http://sobereva.com/451（http://bbs.keinsci.com/thread-11697-1-1.html）
...

老师您好，他的orca环境变量里面。
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/app/orca610/bin，最后应该是bin还是lib？
感谢老师解答？

KazusaT

wangzh 发表于 2025-9-29 19:48
老师您好，他的orca环境变量里面。
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/app/orca610/bin， ...

应该都没有吧。
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/app/orca610

sobereva

wangzh 发表于 2025-9-29 19:48
老师您好，他的orca环境变量里面。
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/app/orca610/bin， ...

ORCA目录下根本没库文件，这行命令毫无意义