如何量化和衡量不同氨基酸在组装能力上的差异

xsc6 · 发表于 Post on 2025-9-28 02:19:09

各位老师好，最近在做一些有关多肽组装方面的课题，即通过多肽的氨基酸组成预测其组装成不同结构的能力，现在在想引入什么参数量化和衡量多肽中氨基酸基元的组装能力的差异，比如苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸，都含有芳香环，但是这三个氨基酸组装（pai-pai相互作用）能力有显著性差异，不知道有什么参数可以定量区别这几个方向性的差别呢？范德华势可以么？谢谢各位老师

18217265596 · 发表于 Post on 2025-9-28 14:10:04

建议直接跑md。

xsc6 · 发表于 Post on 2025-9-28 20:46:26

18217265596 发表于 2025-9-28 14:10
建议直接跑md。

看了很多工作是MD的AP值，但是想做点不一样的，在想量化上有什么参数能区别和衡量

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[综合交流] 如何量化和衡量不同氨基酸在组装能力上的差异

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