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[Gaussian/gview] 求助·OH夺取环己烷H原子的过渡态有多个虚频,怎样消除

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  老师们好,我在寻找·OH夺取环己烷H原子的过渡态,发现了过渡态存在多个虚频,已经尝试过改变manual displacement=0.3 ,加int=superfine 或者opt=tight命令,都无法解决,特此求助。

TS1-3 #p opt=(modredundant,noeigen) freq b3lyp/def2svp empiricaldispersion=gd3bj

TS1-4 #p opt=(modredundant,noeigen) freq b3lyp/def2svp int=superfine empiricaldispersion=gd3bj  加int=superfine

TS1-5 #p opt=(modredundant,noeigen) freq b3lyp/def2svp empiricaldispersion=gd3bj  改变manual displacement=0.3

TS1-6#p opt=(modredundant,noeigen,tight) freq guess=read geom=check b3lyp/def2svp scf=qc empiricaldispersion=gd3bj opt=tight命令

TS1-7 #p opt=(calcfc,noeigen,TS,tight) freq b3lyp/def2tzvp int=superfine empiricaldispersion=gd3bj  改变manual displacement=0.3 加int=superfine  opt=tight命令 但是502错误




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发表于 Post on 2025-9-29 12:07:02 | 只看该作者 Only view this author
别自己手写[Gaussian/gview]这种标签,给你去了,以后注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-29 12:46:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-29 12:07
别自己手写[Gaussian/gview]这种标签,给你去了,以后注意

好的社长,没有注意到

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发表于 Post on 2025-9-29 18:43:02 | 只看该作者 Only view this author

在寻找·OH夺取环己烷H原子的过渡态
如果你确定当前 HO...H 键长比较接近过渡态中的真实键长,可以固定此键长,进行结构优化(优化到极小点,不是过渡态);如果你不确定,可以做个 relaxed scan 试试。
你这个体系不是 “·OH夺取环己烷H原子的过渡态”吧,下面怎么还有一大堆原子



现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-30 20:51:15 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2025-9-29 18:43
如果你确定当前 HO...H 键长比较接近过渡态中的真实键长,可以固定此键长,进行结构优化(优化到极小点, ...

谢谢老师,那我还有一个疑问"可以固定此键长,进行结构优化,优化到极小点"这个意思是指用固定键长优化后极小点的结构作为找过渡态初猜结构吗

下面的原子是我的催化剂。

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发表于 Post on 2025-9-30 21:07:15 | 只看该作者 Only view this author
可以考虑用ORCA优化过渡态,消掉多余的虚频后再改回高斯优化。ORCA有自动消虚频的功能,除了优化极小值点时消除所有的虚频以外,也可以用来消除过渡态的多余的虚频:https://www.faccts.de/docs/orca/ ... rative-optimization
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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