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求助论文发表后发现计算有一些失误该怎么办

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如题所示,我现在论文已经发表,体系是催化体系,投个杂志倒不是很好的,只是一篇三区,现在才发现当时做完的体系在做小原子吸附时没固定,导致基底结构原子位置发生了一些小变化,请问有必要进行修正吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-2 18:28:36 | 只看该作者 Only view this author
一开始做计算的时候是因为不懂,后面懂了的时候忘了前面已经这么算了导致发生了这个错误,现在应该怎么办呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-2 18:35:57 | 只看该作者 Only view this author
主要是因为着急毕业,有点担心勘误会不会被撤稿导致毕业出现问题,所以不是很想勘误,如果不做勘误的话可以吗

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发表于 Post on 2025-10-3 03:53:30 | 只看该作者 Only view this author
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,导致信息零零碎碎,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2025-10-3 04:23:15 | 只看该作者 Only view this author
如果不影响结论、不明显影响结果,只是无关痛痒的小问题,可以不提交修正
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-3 04:28:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-3 04:23
如果不影响结论、不明显影响结果,只是无关痛痒的小问题,可以不提交修正

好的明白了,谢谢社长,发贴子的问题我以后也会注意的,很抱歉

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发表于 Post on 2025-10-3 12:46:35 | 只看该作者 Only view this author
放心吧,想开点,不用修正,也不用担心,安心毕业吧。要是以后真有人问,首先不回答,其次模糊其词装傻。
第一,反正你这不是纯计算研究。如果就是实验性文章加点计算,大概率你的小同行看不懂计算,除非有肉眼可见反常识或者不符合化学直觉的结果。如果就是原子位置轻微不合适,能量算不太准,不会被人看出来。计算就是辅助证明你的结论,不是决定性的。
第二,如果你们领域顶刊有很多一区期刊,那么三区文章没啥人关注的,没人花功夫给编辑举报。大家看一区文章都看不过来的。除非你的竞争对手(假如有的话)看到,并且他还要刚好懂计算,所以这概率巨小。
第三,我做材料方向,我们领域文章以实验为主。大把的文章计算有问题,大多数是小问题,有的是大问题,一区顶刊也有这些问题。我没学计算之前看不出问题,学了计算就看出来了。比如此帖 http://bbs.keinsci.com/thread-55610-1-1.html   不少文章就是为了用计算结果对上实验,懂的都懂
人家这种不科学的论文大把大把发,没人comment说计算不对。这世界就是一个巨大的草台班子,对他们祛魅吧,毕业最要紧,只要不是学术不端,别的不要太纠结

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发表于 Post on 2025-10-3 13:22:27 | 只看该作者 Only view this author
可以用「正确」方法先跑一下,看看会不会影响结论/中心思想。
不会的话就记下来有人问再用它,会的话就要和导师讨论了。
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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发表于 Post on 2025-10-3 14:42:51 | 只看该作者 Only view this author
赞同8#的老师,如果是我的话,就重跑一遍看看趋势或者结论是否一致,没有影响结论的话,趋势也没太大变化(比如A>B>C没有变成A>C>B这种,并且数量级没有太离谱差异),可以先暂时不用管,存着正确数据,等有人讨论再说(其实大概率不会有人较真的)

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发表于 Post on 2025-10-3 14:43:58 | 只看该作者 Only view this author
SharkYYX2025 发表于 2025-10-3 12:46
放心吧,想开点,不用修正,也不用担心,安心毕业吧。要是以后真有人问,首先不回答,其次模糊其词装傻。
...

确实,很多都有错,甚至比较离谱的错

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-3 21:23:03 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 kkkkkkk 于 2025-10-3 21:38 编辑
SharkYYX2025 发表于 2025-10-3 12:46
放心吧,想开点,不用修正,也不用担心,安心毕业吧。要是以后真有人问,首先不回答,其次模糊其词装傻。
...

感谢老师你的回答,是这样的老师,这个是纯计算的小文章,之前是做实验的但结果不好老师让我水一篇简单的计算,但看上去肯定是没什么问题的,而且也是符合常理的,只不过如果复现的话就会被发现有一点差距,但也不大,不是很影响结论,那就这样可以不改吗老师,我这个期刊影响因子也就3左右不算很好的,应该不会有事吧,至于学术不端这个问题,我老师之前和我说学术不端分为犯傻造成的和刻意造假,我如果犯傻造成的学术不端也叫学术不端,这个该怎么界定呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-3 21:25:16 | 只看该作者 Only view this author
lemon_electron 发表于 2025-10-3 14:42
赞同8#的老师,如果是我的话,就重跑一遍看看趋势或者结论是否一致,没有影响结论的话,趋势也没太大变化( ...

好的谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-3 21:25:45 | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2025-10-3 13:22
可以用「正确」方法先跑一下,看看会不会影响结论/中心思想。
不会的话就记下来有人问再用它,会的话就要 ...

好的老师,十分感谢

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发表于 Post on 2025-10-4 01:14:43 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 SharkYYX2025 于 2025-10-4 01:34 编辑
kkkkkkk 发表于 2025-10-3 21:23
感谢老师你的回答,是这样的老师,这个是纯计算的小文章,之前是做实验的但结果不好老师让我水一篇简单的 ...

纯计算的文章的话,那能发出来就是已经送了计算方向的审稿人,审稿人看不出来的话,我觉得没啥问题。
至于有没有问题,主要是看你的误差在哪里。不影响结论的话,完全不用担心

比如结构收敛的不太好(正常要10负8次方,你用的10负7次方),某个原子轻微偏移,能量差了一点点,这种没问题,仅仅是不严谨,不是错误和造假。你也可以解释成你的计算级别有限,算力有限,或者选的计算方法不是最理想的(但不能压根是错的),基组不是那么完备。别人换个计算级别,和你有误差,这是能接受的。退一步说,我拿文献一样的计算级别方法算别人的分子ESP HOMO,算出来接近,也不算完全一样,我不会认为别人论文有问题。如果你的误差仅仅是这种级别,完全不用担心别人质疑。别人如果问,你这最多是结果不那么精确,不是有错。因为并不可能什么都拿CCSD高精度级别去计算,算的合理就行

我举例说几个不能接受的情况,把不可能是纯平面的分子结构算成平面的,因为他完全没做几何优化,徒手画了一个就去算单点能,实际上他的分子因为位阻不可能成平面结构(真有这种,做实验的组做的计算,超级外行)。还有个例子,卢老师做的18碳环系列 http://sobereva.com/carbon_ring.html 有人把C-C长短交替,算成等同键长双键。这种科学问题一定会被comment,迟早的

我觉得你这样不算学术不端。学术不端是个虚的、宽泛的罪名,看起来啥都能往里套。说严格了,什么 数据处理不当,引用不全(指漏了本领域重要文献),错别字,这些鸡毛蒜皮的小事也算学术不端。实际上就是民不举官不究。没人质疑,这些都不算事。顶刊也有不小心写错图的坐标轴名字,然后勘误的。通常能被人实锤的就是图片故意PS,图片重复,整段抄袭,这种主观的造假很严重的。我是做实验的,材料领域做实验,普遍有稍微优化/美化数据的时候,正常思路肯定是展示好数据不展示坏的。(比如,我做了10组实验,9组好1组坏,9组趋势一致。我放弃了那一组坏的,只展示好的9组。这是合理取舍,那差的一组是随机误差)。但是不能故意颠倒黑白,把差的材料说成好的(比如我无视那9组的共同趋势,故意只展示那一组不合常理的,搞个大新闻)。不能伪造数据。我觉得,只要数据不是编的P的偷的,通常都不是事。但还是建议大家严谨学术,严格要求自己

你这影响因子不高,真的不用担心,不用改。。看的人少,没有那么多人关注,不太有人会去复现别人文章的结果。大家都很忙,不会过多关注别人。而且如果真有人质疑,你完全有办法回应他。谁质疑谁举证,他首先得会计算 把这复现一下,而且得充分证明他对你不对,还得等到编辑回应他,这才算质疑成功。他质疑,你也可以battle。他费这个劲也图不到啥,何必。而且编辑忙死了,不乐意管这个吧

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-4 03:57:20 | 只看该作者 Only view this author
SharkYYX2025 发表于 2025-10-4 01:14
纯计算的文章的话,那能发出来就是已经送了计算方向的审稿人,审稿人看不出来的话,我觉得没啥问题。
至 ...

十分感谢老师这么认真的回复,真的特别感谢,这几天晚上都睡不着觉,因为我这导师有点容易上纲上线,我如果和他说这个问题我是一定毕不了业的,哪怕能勘误来得及他也会卡我一年,那我就放心了,祝您生活愉快

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