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[GROMACS] 请教gmx_MMPBSA的安装

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楼主
官网的env.yml文件如下:
  1. name: gmxMMPBSA
  2. channels:
  3.   - defaults
  4.   - conda-forge
  5. dependencies:
  6.   - python=3.11.8
  7.   - pip
  8.   - numpy=1.26.4
  9.   - ambertools=23.6
  10.   - mpi4py=4.0.1
  11.   - matplotlib=3.7.3
  12.   - scipy=1.14.1
  13.   - parmed=4.2.2


  14.   - pandas=1.5.3
  15.   - seaborn=0.11.2
  16.   - tqdm

  17.   - git
  18.   - gromacs<=2024.3
  19.   - pip:
  20.       - pyqt6==6.7.1
复制代码
但似乎我安装的版本和这些都不大一样,比如我的gromacs的版本是2024.5,python的版本是3.13.7,ambertool的版本是2024版,conda的版本是25.9.1,请问我该如何修改这些参数呢?麻烦大家指教,非常感谢!

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发表于 Post on 2025-10-17 17:15:08 | 只看该作者 Only view this author
我不知道他跟gromacs版本的搭配如何,不过你直接conda create一个新虚拟环境装他指定的python库不就好了?

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发表于 Post on 2025-10-17 17:23:18 | 只看该作者 Only view this author
按这个贴子的命令安装试试:http://bbs.keinsci.com/thread-54666-1-1.html

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