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[VMD] 在VMD中绘制IGMH等值面图报错

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我用使用Multiwfn结合CP2K通过NCI和IGM方法图形化考察固体和表面的弱相互作用 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元里面的方法,出现了问题
步骤:
20  //图形化分析弱相互作用
10  //IGM
2  //定义两个片段
1-72  //第一个片段的原子序号,即两层COF其中一层中的原子
73-144  //第二个片段的原子序号,即另一层COF中的原子
9  //借助晶胞信息设置格点
[按回车]  //用0,0,0作为盒子原点
[按回车]  //用晶胞边长作为盒子边长
0.4  //格点间距。然后将生成的dg_inter.cub、dg_intra.cub、dg.cub和sl2r.cub,将它们都挪到VMD目录下。并且把Multiwfn目录下的examples文件夹中的IGM绘图脚本IGM_inter.vmd和IGM_intra.vmd都复制到VMD目录下。
然后打开vmd输入source IGM_inter.vmd 。出现了问题。请各位大佬指导一下我哪里出现了问题。
通过网盘分享的文件:输入文件和生成文件.zip
链接: https://pan.baidu.com/s/1UoLLf5W9Tq2ucB8j3Hcx8Q 提取码: rc37

d7305cc11e0e621ea43bfd348a0409c.png (14.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

d7305cc11e0e621ea43bfd348a0409c.png

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发表于 Post on 2025-10-22 13:00:25 | 只看该作者 Only view this author
vmd 命令行那边pwd看所在目录
cd到有cub文件的目录或将cub文件放在该目录
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-22 13:52:02 | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2025-10-22 13:00
vmd 命令行那边pwd看所在目录
cd到有cub文件的目录或将cub文件放在该目录

好的,谢谢大佬的指导,我已经放在该目录了,还是识别不到文件

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发表于 Post on 2025-10-23 08:21:43 | 只看该作者 Only view this author
qq1966789 发表于 2025-10-22 13:52
好的,谢谢大佬的指导,我已经放在该目录了,还是识别不到文件

纯粹是要被读取的cub文件没放在当前目录下,脚本找不到文件,没有任何其它原因
当前目录在VMD的命令行窗口用pwd命令查看
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-24 09:50:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-23 08:21
纯粹是要被读取的cub文件没放在当前目录下,脚本找不到文件,没有任何其它原因
当前目录在VMD的命令行窗 ...

好的,谢谢社长指导

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