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[CP2K] 关于“Cu(410)表面重构”练习的疑问

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楼主
本帖最后由 spinel 于 2025-10-26 10:01 编辑

请教卢老师,我参考了CP2K培训班中Si(001)面重构的例子,自己练习了Cu(410)表面重构的例子。输入文件(Cu410.inp),输出文件(Cu410.out),建模文件(Cu410.gjf)已经上传。我使用Multiwfn创建了输入文件,开启smearing,K点设置331,周期性设置XY,冻结了最底层的原子。最后还是无法收敛,请问这个是什么问题呢?

Cu410.gjf

6.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

Cu410.inp

9.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

Cu410.out

345.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

第二次模拟.zip

4.42 MB, 下载次数 Times of downloads: 3

第三次模拟.rar

7 MB, 下载次数 Times of downloads: 0

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发表于 Post on 2025-10-22 19:39:40 | 只看该作者 Only view this author
结构有异常接近(距离小于1埃)的铜原子,看来是和http://bbs.keinsci.com/thread-55090-1-1.html类似的GaussView建模错误。我推荐用VESTA做此类旋转、切面的操作。
√546=23.36664289109

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发表于 Post on 2025-10-22 20:50:28 | 只看该作者 Only view this author
没轨迹文件没法判断后来变成什么样了。几何优化最后一步有SCF收敛趋势,在排除其它硬伤后,对此问题可以增大SCF圈数上限,或者按提示加上IGNORE_CONVERGENCE_FAILURE
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-22 21:01:53 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-10-22 19:39
结构有异常接近(距离小于1埃)的铜原子,看来是和http://bbs.keinsci.com/thread-55090-1-1.html类似的Gau ...

好的,谢谢老师,我去试一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-22 21:02:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-22 20:50
没轨迹文件没法判断后来变成什么样了。几何优化最后一步有SCF收敛趋势,在排除其它硬伤后,对此问题可以增 ...

好的,感谢卢老师的回复,我去试一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-23 20:48:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-22 20:50
没轨迹文件没法判断后来变成什么样了。几何优化最后一步有SCF收敛趋势,在排除其它硬伤后,对此问题可以增 ...

请教卢老师,我按照2楼老师的建议,使用vesta重新构建了一个正交的Cu(410)模型,对其中编号213的Cu移动了一点初始位置,重新进行了模拟,相关文件以压缩包形式上传(名为"第二次模拟”)。根据轨迹文件,随着结构优化的进行,初始被移动的原子逐渐回到了原本的位置,优化结束后整体和优化前基本没有明显变化。未出现预期的Cu(410)表面重构的现象。请问这次模拟主要存在的问题是什么呢?

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发表于 Post on 2025-10-23 21:44:05 | 只看该作者 Only view this author
spinel 发表于 2025-10-23 20:48
请教卢老师,我按照2楼老师的建议,使用vesta重新构建了一个正交的Cu(410)模型,对其中编号213的Cu移动了 ...

可能初始位移还不够显著(不只考虑一个原子的位移)
并且做动力学模拟大概率更容易观察到表面重构
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-26 10:06:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-23 21:44
可能初始位移还不够显著(不只考虑一个原子的位移)
并且做动力学模拟大概率更容易观察到表面重构

感谢老师的建议,我重新做了模拟,相关文件已经上传(压缩包“第三次模拟”)。本次我调整了表面一层和第二层原子的位置,让表面原子的初始位置尽量都在一个斜面上。使用AIMD模拟表面重构过程。为了加速重构,我把温度从默认值调到600K。根据轨迹文件,随着模拟的进行,表面原子逐渐重构为410面(即和刚切完晶面一样),还是没有观察到预期的410面重构现象。请问老师下一步我该如何改进呢?

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