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[新手求助] 求助gaussview导出的gjf文件中找不到正确对应的键角和二面角

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在gaussview中显示的结构是正确的,但是导出gjf文件想要进行刚性扫描时,找不到正确对应的键角和二面角,角度都很奇怪,并且在一些不相连的原子之间出现了键角,请问这种是什么原因

202511121548498054..png (12.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

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发表于 Post on 2025-11-13 01:29:20 | 只看该作者 Only view this author
本来描述内坐标用的键长键角项就没有必然性非得出现在成键的原子间

没有合适的键角、二面角项用来扫描就自己调整内坐标定义,要么柔性扫描

刚性扫描特定二面角也可以借助gentor,看下文,此时不需要gjf里有专门的二面角项
详谈使用Gaussian做势能面扫描
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北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-14 15:37:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-11-13 01:29
本来描述内坐标用的键长键角项就没有必然性非得出现在成键的原子间

没有合适的键角、二面角项用来扫描就 ...

请问如何调整内坐标定义呀?

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发表于 Post on 2025-11-15 05:10:11 | 只看该作者 Only view this author
YMX 发表于 2025-11-14 15:37
请问如何调整内坐标定义呀?

根据常识恰当写内坐标,使得有内坐标直接对应要扫描的变量
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