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[Molclus] 求助molclus做一个水凝胶和亚甲基蓝的构象搜索,结构都优化失败了

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各位老师好,我目前在做一个水凝胶(很大)(里面没有过渡金属)和亚甲基蓝的构象搜索,正在做高斯优化,但是结构都优化失败了,现在isomers.xyz里面是空白的,请问各位老师应该怎么办?

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发表于 Post on 2025-11-17 16:28:42 | 只看该作者 Only view this author
1. 不要拍照,屏幕输出截屏即可,输入文件建议直接上传附件。
2. 按照论坛发帖时务必注意恰当填写标题要求正确填写标题。
3. 为什么要写两遍Title、电荷、自旋多重度和[GEOMETRY]?

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发表于 Post on 2025-11-17 19:06:29 | 只看该作者 Only view this author
认真看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,尽快修改帖子标题,避免损害论坛形象。写一堆什么乱七八糟的
如果2天内标题没修改,将删帖扣分处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-17 21:55:18 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2025-11-17 16:28
1. 不要拍照,屏幕输出截屏即可,输入文件建议直接上传附件。
2. 按照论坛发帖时务必注意恰当填写标题要求 ...

好的好的,谢谢老师,已经重新修改了标题,同时之后我会先认真检查再发帖子,我已经重新计算了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-17 21:55:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-11-17 19:06
认真看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,尽快修改帖子标题,避免损害论坛形象。写一堆什么乱 ...

好的,社长,已经修改了,以后我会注意的

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发表于 Post on 2025-11-17 22:12:16 | 只看该作者 Only view this author
你的信息给的太模糊了
1. 你这个很大到底是多大啊,一两百原子?几百原子?上千原子?
2. 让molclus保留失败的文件备份,看看具体是为什么优化失败了
3. 既然体系很大、还写了opt=tight、还写了maxcyc=40,你是期望他在40轮优化中就达到tight收敛限吗。。。?

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公社社长

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发表于 Post on 2025-11-18 02:26:52 | 只看该作者 Only view this author
Molclus FAQ
http://sobereva.com/730http://bbs.keinsci.com/thread-50349-1-1.html
看Q9

没事甭用tight收敛限,既没必要、对柔性大体系又难达到,还明显更花时间。区区40轮迭代次数上限也根本不够
要结合被调用的程序的基本使用常识来使用molclus
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-20 12:40:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-11-18 02:26
Molclus FAQ
http://sobereva.com/730(http://bbs.keinsci.com/thread-50349-1-1.html)
看Q9

好的,好的,谢谢社长

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