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[CP2K] 求助使用CP2K计算得到的density1.cub和ESP1.cub结合VMD作静电势图,发生闪退

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我想绘制CP2K周期性计算的静电势图,已严格按照使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示) - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元此博文将相关文件脚本移动到对应目录,先前成功绘制出Gaussian计算的孤立分子的静电势图,因此这里应该没有操作错误,根据上图sob老师的回复,使用CP2K产生的电子密度和静电势文件分别改名为density1.cub和ESP1.cub后丢进VMD目录下,然而,当我输入iso后, ,运行到上图时发生闪退,已将相关的cub文件及inp文件上传至以下网盘链接通过网盘分享的文件:EPS.zip
链接: https://pan.baidu.com/s/15dTOccXs1ELoHUbIWPCFRg?pwd=wuko 提取码: wuko
,想请教一下各位如何解决这一问题。

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发表于 Post on 2025-11-27 12:59:37 | 只看该作者 Only view this author
如果用的32bit VMD,改用64 bit再试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-27 15:59:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-11-27 12:59
如果用的32bit VMD,改用64 bit再试

谢谢老师,换成64bit版本就可以了。

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发表于 Post on 2026-2-3 21:53:57 | 只看该作者 Only view this author
2429783189 发表于 2025-11-27 15:59
谢谢老师,换成64bit版本就可以了。

您好,打扰您了,有个问题想请教一下,我下载的vmd200a6win64-Setup版本,实在没找到下图更改颜色的地方,请问怎么更改?谢谢!

微信图片_20260203215049.png (756.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 93)

微信图片_20260203215049.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-2-3 23:13:43 | 只看该作者 Only view this author
xiaofei123 发表于 2026-2-3 21:53
您好,打扰您了,有个问题想请教一下,我下载的vmd200a6win64-Setup版本,实在没找到下图更改颜色的地方 ...

我不确定我之前用的VMD32bit和你是不是一个版本,这个界面在我用的64和32bit版本里,都是在Graphics-colors-color scale里面。

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发表于 Post on 2026-2-4 10:07:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xiaofei123 于 2026-2-4 10:48 编辑
2429783189 发表于 2026-2-3 23:13
我不确定我之前用的VMD32bit和你是不是一个版本,这个界面在我用的64和32bit版本里,都是在Graphics-colo ...

谢谢回复,已经解决

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发表于 Post on 2026-6-25 12:34:47 | 只看该作者 Only view this author
你好我想请教一下,怎么用CP2K产生周期性体系的电子密度和静电势文件

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-25 20:03:59 | 只看该作者 Only view this author
仙台叶月 发表于 2026-6-25 12:34
你好我想请教一下,怎么用CP2K产生周期性体系的电子密度和静电势文件

Multiwfn生成CP2K输入文件时可选择让它导出对应cube

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发表于 Post on 2026-6-27 11:41:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 仙台叶月 于 2026-6-27 11:47 编辑
2429783189 发表于 2026-6-25 20:03
Multiwfn生成CP2K输入文件时可选择让它导出对应cube

我是用cif文件给Multiwfn生成的CP2K输入文件。最后算出来的静电势很大。感觉不太合理。对产生CP2K输入文件有什么要求吗?

附上我设置CP2K输入文件的图

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-27 20:49:50 | 只看该作者 Only view this author
仙台叶月 发表于 2026-6-27 11:41
我是用cif文件给Multiwfn生成的CP2K输入文件。最后算出来的静电势很大。感觉不太合理。对产生CP2K输入文 ...

你的体系带电吗?如果带电,算出来“很大”好像未必一定不合理。

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发表于 Post on 2026-7-2 12:55:09 | 只看该作者 Only view this author
2429783189 发表于 2026-6-27 20:49
你的体系带电吗?如果带电,算出来“很大”好像未必一定不合理。

我的体系是COF膜。ESP图得到的值全是正的。我感觉应该是cub文件的问题。创建inp文件的时候需要勾选-4计算电荷吗?还是cif文件里就得带电荷

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