“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 412|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 寻找F原子转移的过渡态,柔性扫描得不到能量最大值点

[复制链接 Copy URL]

19

帖子

0

威望

261

eV
积分
280

Level 3 能力者

各位老师好,寻找F原子转移的过渡态,反应物如图所示,产物是7号F从6号C上脱去,连到23号B上。针对7和23这两个原子,我在m062x级别下做了键长的柔性扫描,关键词如下,发现体系能量随着键长缩短单调上升,见附图。想问出现这种情况的原因是什么,能说明该反应是无能垒反应吗?

Scan.png (68.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 24)

Scan.png

ts.png (126.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

ts.png

gjf.png (87.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 24)

gjf.png

ts1_scan3.7z

3.87 MB, 下载次数 Times of downloads: 1

792

帖子

15

威望

3382

eV
积分
4474

Level 6 (一方通行)

鸩羽

2#
发表于 Post on 2025-12-5 13:58:43 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wal 于 2025-12-5 13:59 编辑

这个曲线能量是单调上升的,还上了0.2ha,无垒不无垒先不说,真能发生吗
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

19

帖子

0

威望

261

eV
积分
280

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-5 14:54:52 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-12-5 13:58
这个曲线能量是单调上升的,还上了0.2ha,无垒不无垒先不说,真能发生吗

我也不太能确定,所以发帖请教下各位老师。。。还是这个体系,之前用PM6-D3柔性扫描能找到能量最高值点,IRC也验证了过渡态,在其结果上用M062X又试了下找不到过渡态。之后直接用M062X做柔性扫描得到的就是这样一个能量上升的曲线

528

帖子

1

威望

2454

eV
积分
3002

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2025-12-5 15:01:13 | 只看该作者 Only view this author
你的反应中用的溶剂是什么?有可能是一两个溶剂分子与你的反应物形成一个复合物,然后fluoride transfer是在溶剂辅助下发生的。

19

帖子

0

威望

261

eV
积分
280

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-5 15:22:56 | 只看该作者 Only view this author
Daniel_Arndt 发表于 2025-12-5 15:01
你的反应中用的溶剂是什么?有可能是一两个溶剂分子与你的反应物形成一个复合物,然后fluoride transfer是 ...

您好,谢谢您提供的思路。图中的含氟分子(FEC)就是反应溶剂的一种,除此以外另一溶剂是EMC(碳酸甲乙酯),不太能确定EMC对该反应的影响。我最初猜想是TPFPB的B夺取FEC的F形成四配位的B,伴随着一个fluoride transfer过程,随后FEC脱H,TPFPB脱F发生消去反应形成HF,VC还有TPFPB。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-13 13:51 , Processed in 0.223452 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list