计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 201|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] cp2k的过程中遇到内存不足,程序被终止

[复制链接 Copy URL]

4

帖子

0

威望

50

eV
积分
54

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 sujie_0910 于 2025-12-11 18:17 编辑

各位老师好,
       我在跑cp2k的过程中遇到了严重的内存问题。用48核跑一个AIMD计算的任务,跑一个仅仅200个原子的任务,任务跑不到10步就死掉了,然后提示内存不足,我不明白为什么会这样?才学了一天CP2K,想先顺利跑起来,请各位老师给出一点建议或方向?
以下是任务输入文件和脚本







谢谢老师回答,我重新长传了输出文件和另一个文件

layer.inp

16.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

job.sh

466 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 3

cp2k_%j.out

64.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

Layer-1.ener

791 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124668

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2025-12-11 17:38:47 | 只看该作者 Only view this author
说清楚哪显示内存不足,给出具体截图或输出文件。初学者不具备判断能力,别自行推断

当前初始结构比较糟糕,很多原子间键长明显不合理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

4

帖子

0

威望

50

eV
积分
54

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-11 18:17:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-11 17:38
说清楚哪显示内存不足,给出具体截图或输出文件。初学者不具备判断能力,别自行推断

当前初始结构比较糟 ...

谢谢sob老师,已经重新上传了文件

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124668

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2025-12-11 22:24:14 | 只看该作者 Only view this author
运行环境或者编译得有问题
尝试减少并行核数,或者自己按照下文重新编译
CP2K第一性原理程序在Linux中的安装方法
http://sobereva.com/586http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-23 22:21 , Processed in 0.263509 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list