在进行限制性优化时，原子间键长没有定住，有虚频H原子却不振动

王小凡 · 发表于 Post on 2017-5-4 10:07:13

根据限制性优化的算例更改了输入文件，但是5号C和16号S键长却没有定住，得出的过渡态结果有自由能，有虚频，但是H原子却不振动。
已将附件上传，求帮助。

sobereva · 发表于 Post on 2017-5-4 10:45:21

你这种写法使得5和16号原子可以优化，其它保持不动（诸如C-C键，第一帧和最后一帧是相同的），和你的目的完全不符。
这种做法也别指望能得到合理的过渡态。输入文件里redundant、test是完全多余的。

王小凡 · 发表于 Post on 2017-5-4 14:50:37

sobereva 发表于 2017-5-4 10:45
你这种写法使得5和16号原子可以优化，其它保持不动（诸如C-C键，第一帧和最后一帧是相同的），和你的目的完 ...

可以指导一下该怎么改么？

王小凡 · 发表于 Post on 2017-5-4 14:51:44

sobereva 发表于 2017-5-4 10:45
你这种写法使得5和16号原子可以优化，其它保持不动（诸如C-C键，第一帧和最后一帧是相同的），和你的目的完 ...

是把noatom和atom换一下，还是把其他原子序号放在atom后面呢？

王小凡 · 发表于 Post on 2017-5-4 14:52:13

sobereva 发表于 2017-5-4 10:45
你这种写法使得5和16号原子可以优化，其它保持不动（诸如C-C键，第一帧和最后一帧是相同的），和你的目的完 ...

这种做法不能找到过渡态的主要问题是什么呢？

sobereva · 发表于 Post on 2017-5-4 19:27:45

王小凡发表于 2017-5-4 14:52
这种做法不能找到过渡态的主要问题是什么呢？

直接给个过渡态初猜用opt(TS,calcfc,noeigen)来找就完了。
你当前这么设定，从原理上就没法得到过渡态，过渡态没这么找的。
过渡态算法见
过渡态、反应路径的计算方法及相关问题
http://sobereva.com/44

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[Gaussian/gview] 在进行限制性优化时，原子间键长没有定住，有虚频H原子却不振动